More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2583 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  52.13 
 
 		 729 aa  727    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 729 aa  1462    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 		 786 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 767 aa  203  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 883 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4236  tetratricopeptide TPR_2  23.7 
 
 		 824 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  21.32 
 
 		 934 aa  124  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 878 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.71 
 
 		 882 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.96 
 
 		 882 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 567 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 		 557 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1676 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 931 aa  110  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 800 aa  110  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 		 860 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.63 
 
 		 2240 aa  108  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  23.45 
 
 		 864 aa  108  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.75 
 
 		 571 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 923 aa  105  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 		 722 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 884 aa  101  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.79 
 
 		 1056 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.89 
 
 		 884 aa  98.2  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.2 
 
 		 883 aa  94  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  22.52 
 
 		 929 aa  93.6  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.99 
 
 		 603 aa  93.6  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.99 
 
 		 553 aa  93.6  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  26.3 
 
 		 586 aa  92.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.78 
 
 		 810 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 886 aa  91.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 573 aa  91.3  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 955 aa  90.1  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.19 
 
 		 935 aa  90.5  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.51 
 
 		 1056 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 952 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  23.88 
 
 		 924 aa  89  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  25.15 
 
 		 832 aa  89  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 927 aa  88.2  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.51 
 
 		 818 aa  87.8  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 873 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  25.49 
 
 		 573 aa  87  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  20.75 
 
 		 924 aa  85.9  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 827 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.51 
 
 		 784 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  22.92 
 
 		 931 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.21 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 2262 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 643 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3385  tetratricopeptide  24 
 
 		 811 aa  84  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.25 
 
 		 639 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1566  TPR repeat-containing protein  21.59 
 
 		 738 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.411848  hitchhiker  0.00925631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 3145 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.25 
 
 		 573 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.17 
 
 		 1421 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.57 
 
 		 1486 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  39.84 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  30.39 
 
 		 677 aa  81.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 808 aa  80.9  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.48 
 
 		 1154 aa  80.9  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 620 aa  79.3  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 313 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 673 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.9 
 
 		 573 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.3 
 
 		 3172 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 568 aa  78.2  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 2262 aa  78.2  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 562 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1112 aa  77.8  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.1 
 
 		 758 aa  77.4  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.49 
 
 		 599 aa  77.4  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 4079 aa  77.4  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.88 
 
 		 1737 aa  77.4  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  27.56 
 
 		 573 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  22.94 
 
 		 579 aa  76.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  24.07 
 
 		 1764 aa  77  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.54 
 
 		 725 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.38 
 
 		 924 aa  77  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.45 
 
 		 988 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  28.64 
 
 		 572 aa  77  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 900 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  34.15 
 
 		 583 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  38.39 
 
 		 632 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.12 
 
 		 572 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.18 
 
 		 624 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 762 aa  75.5  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 886 aa  75.1  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 566 aa  75.1  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 573 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 573 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 767 aa  75.1  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 		 579 aa  74.7  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>