More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1530 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 873 aa  1692    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  42.05 
 
 		 935 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 955 aa  373  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 934 aa  325  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.48 
 
 		 929 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  28.18 
 
 		 924 aa  194  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 931 aa  146  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 884 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  24.97 
 
 		 927 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  22.56 
 
 		 918 aa  127  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 		 860 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.91 
 
 		 882 aa  122  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.55 
 
 		 884 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  23.32 
 
 		 924 aa  118  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  22.05 
 
 		 937 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.44 
 
 		 882 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  24.41 
 
 		 931 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  21.37 
 
 		 924 aa  109  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 923 aa  107  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.63 
 
 		 729 aa  106  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 917 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 952 aa  103  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 883 aa  101  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 729 aa  101  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 944 aa  95.9  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 767 aa  92.4  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1069 aa  89  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.01 
 
 		 1694 aa  88.2  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.09 
 
 		 1979 aa  87.8  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 		 639 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.17 
 
 		 810 aa  85.5  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 886 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 878 aa  84.7  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.1 
 
 		 733 aa  84.3  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  19.18 
 
 		 927 aa  84.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 900 aa  82.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.6 
 
 		 883 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  20.91 
 
 		 940 aa  82  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  20.9 
 
 		 1056 aa  80.5  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  25.21 
 
 		 586 aa  79.7  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  20.3 
 
 		 892 aa  79.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.17 
 
 		 573 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 567 aa  79  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.16 
 
 		 3172 aa  79  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  33.79 
 
 		 914 aa  77.4  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 2262 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.86 
 
 		 1737 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.5 
 
 		 1067 aa  77  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  19.6 
 
 		 1676 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 3145 aa  75.5  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 808 aa  75.1  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 591 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 486 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  21.09 
 
 		 543 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.03 
 
 		 750 aa  72.8  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 4079 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.9 
 
 		 582 aa  72.4  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.24 
 
 		 572 aa  72  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  19.61 
 
 		 1486 aa  71.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3385  tetratricopeptide  25.26 
 
 		 811 aa  71.6  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.08 
 
 		 573 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  20.18 
 
 		 602 aa  70.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 880 aa  70.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  20.25 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  20.41 
 
 		 1276 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 968 aa  68.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  25.88 
 
 		 661 aa  68.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 886 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.37 
 
 		 462 aa  67.4  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  18.89 
 
 		 887 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  24 
 
 		 725 aa  67  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.14 
 
 		 603 aa  66.6  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  25.76 
 
 		 933 aa  66.6  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.54 
 
 		 566 aa  66.6  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 		 786 aa  66.6  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  21.31 
 
 		 864 aa  66.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  20.13 
 
 		 917 aa  66.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.14 
 
 		 553 aa  66.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  27.25 
 
 		 584 aa  66.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  19.82 
 
 		 1421 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.86 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.86 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.98 
 
 		 2240 aa  65.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.94 
 
 		 875 aa  65.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 955 aa  65.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.16 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 2262 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 762 aa  64.7  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  21.21 
 
 		 573 aa  64.3  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.87 
 
 		 576 aa  64.3  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.84 
 
 		 3301 aa  64.3  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 686 aa  64.3  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  18.66 
 
 		 557 aa  62.8  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.13 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  26.48 
 
 		 1077 aa  63.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  29.48 
 
 		 1237 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>