225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0419 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  38.97 
 
 		 924 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 917 aa  1850    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  25.31 
 
 		 917 aa  278  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  27.08 
 
 		 914 aa  276  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  26.23 
 
 		 918 aa  244  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  23.88 
 
 		 892 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  26.3 
 
 		 929 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.06 
 
 		 935 aa  162  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 927 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 934 aa  144  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 923 aa  129  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  22.21 
 
 		 955 aa  110  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 931 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  23.58 
 
 		 924 aa  99  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 944 aa  95.1  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 883 aa  90.9  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 952 aa  90.1  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.25 
 
 		 883 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  21.19 
 
 		 873 aa  81.3  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.99 
 
 		 810 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.48 
 
 		 1979 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.91 
 
 		 1694 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 878 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  24.8 
 
 		 586 aa  72  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.03 
 
 		 884 aa  71.6  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.85 
 
 		 1056 aa  71.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 860 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  22.56 
 
 		 933 aa  70.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 4079 aa  67.8  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.73 
 
 		 882 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.66 
 
 		 557 aa  67  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 301 aa  67  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  21.35 
 
 		 900 aa  66.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 		 884 aa  65.1  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  22.44 
 
 		 864 aa  64.3  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 955 aa  64.3  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  21.76 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1676 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.18 
 
 		 562 aa  62  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  20.91 
 
 		 924 aa  62  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.24 
 
 		 882 aa  61.6  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  22.78 
 
 		 931 aa  61.6  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.81 
 
 		 784 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.81 
 
 		 2240 aa  61.2  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 562 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.64 
 
 		 833 aa  60.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 421 aa  60.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.48 
 
 		 786 aa  59.3  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1138 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.83 
 
 		 988 aa  58.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  23.22 
 
 		 579 aa  57.8  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.85 
 
 		 571 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.02 
 
 		 465 aa  57  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 620 aa  57  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 582 aa  57  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.76 
 
 		 1022 aa  57  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4639  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 311 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  22.45 
 
 		 519 aa  55.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  21.01 
 
 		 937 aa  55.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  21.91 
 
 		 409 aa  55.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.14 
 
 		 784 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 585 aa  55.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  18.95 
 
 		 573 aa  55.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.43 
 
 		 632 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 1069 aa  54.7  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 288 aa  54.7  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 291 aa  54.3  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.98 
 
 		 1056 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  21.78 
 
 		 729 aa  54.3  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 886 aa  53.9  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 292 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 1276 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.94 
 
 		 725 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 643 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 870 aa  53.5  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.74 
 
 		 818 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0021  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 593 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 880 aa  53.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  23.71 
 
 		 595 aa  53.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 409 aa  53.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01310  TPR domain protein  21.46 
 
 		 893 aa  52.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  23.19 
 
 		 620 aa  52.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 292 aa  52  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  23.3 
 
 		 635 aa  52  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1566  TPR repeat-containing protein  42.25 
 
 		 738 aa  52  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.411848  hitchhiker  0.00925631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  20.77 
 
 		 3035 aa  52  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.68 
 
 		 750 aa  51.6  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 		 1838 aa  51.6  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 620 aa  51.6  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  20.9 
 
 		 1056 aa  51.6  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  20.55 
 
 		 409 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 221 aa  50.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 729 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0939  hypothetical protein  30.3 
 
 		 287 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 		 293 aa  50.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 886 aa  51.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.6 
 
 		 566 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.67 
 
 		 689 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>