109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3385 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3385  tetratricopeptide  100 
 
 		 811 aa  1611    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4236  tetratricopeptide TPR_2  43.62 
 
 		 824 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 800 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.23 
 
 		 786 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  21.65 
 
 		 729 aa  97.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.08 
 
 		 557 aa  85.5  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 955 aa  83.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 900 aa  83.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 767 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.73 
 
 		 935 aa  80.5  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  20.4 
 
 		 883 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 884 aa  75.1  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 729 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 952 aa  70.5  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 594 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.44 
 
 		 603 aa  66.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.65 
 
 		 553 aa  65.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 638 aa  64.7  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  22.93 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 873 aa  62.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  21.96 
 
 		 929 aa  61.2  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 673 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.65 
 
 		 639 aa  59.3  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 886 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 464 aa  57  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 860 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 2262 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 796 aa  55.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.44 
 
 		 883 aa  55.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.38 
 
 		 397 aa  55.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.17 
 
 		 363 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.17 
 
 		 363 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  34.04 
 
 		 864 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 556 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 722 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  23.61 
 
 		 575 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 573 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.26 
 
 		 582 aa  53.9  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 931 aa  53.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 968 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 2262 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 573 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  39.13 
 
 		 573 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 		 992 aa  52.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  23.14 
 
 		 590 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 573 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1253  hypothetical protein  25 
 
 		 593 aa  51.6  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.177752  unclonable  0.0000127054 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 		 581 aa  51.2  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.46 
 
 		 566 aa  50.8  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  25.31 
 
 		 575 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  22.41 
 
 		 574 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 559 aa  50.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 585 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  20.56 
 
 		 1676 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  20.54 
 
 		 573 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 364 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 886 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  21.21 
 
 		 620 aa  49.3  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 562 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  30.13 
 
 		 559 aa  49.3  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  23.06 
 
 		 520 aa  49.3  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.82 
 
 		 563 aa  48.5  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  19.91 
 
 		 2059 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 602 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.75 
 
 		 804 aa  48.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  18.99 
 
 		 614 aa  48.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 221 aa  48.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 402 aa  48.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 579 aa  48.1  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 575 aa  48.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.58 
 
 		 274 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.54 
 
 		 882 aa  47.8  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.73 
 
 		 882 aa  47.8  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  29.09 
 
 		 579 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 581 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  21.97 
 
 		 573 aa  47.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  29.22 
 
 		 591 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  26.9 
 
 		 663 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  21.03 
 
 		 567 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 423 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 880 aa  47.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 265 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  24.77 
 
 		 940 aa  47  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  20.89 
 
 		 511 aa  46.6  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03573  tetratricopeptide repeat family  26.7 
 
 		 690 aa  47  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.58 
 
 		 274 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1138 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  36.56 
 
 		 572 aa  45.8  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  38.98 
 
 		 632 aa  45.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  28.15 
 
 		 475 aa  45.8  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 612 aa  45.8  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 468 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  23.53 
 
 		 638 aa  45.8  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 927 aa  45.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 274 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 3172 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  28.3 
 
 		 453 aa  45.8  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 586 aa  45.4  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>