160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0423 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 880 aa  1758    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0178  hypothetical protein  27.66 
 
 		 880 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 900 aa  180  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.52 
 
 		 929 aa  134  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.99 
 
 		 935 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  20.49 
 
 		 931 aa  111  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 883 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 927 aa  100  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  24.96 
 
 		 952 aa  94.4  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 		 884 aa  89.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 		 860 aa  87.8  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  21.44 
 
 		 944 aa  85.5  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  21.37 
 
 		 864 aa  82  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 		 934 aa  77.4  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.95 
 
 		 571 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.39 
 
 		 582 aa  70.5  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  26.13 
 
 		 914 aa  69.3  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.7 
 
 		 884 aa  69.7  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  35.34 
 
 		 882 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 955 aa  68.2  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  20.41 
 
 		 924 aa  66.6  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 923 aa  66.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.38 
 
 		 579 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  27.03 
 
 		 892 aa  63.9  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  22.13 
 
 		 729 aa  64.3  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 620 aa  63.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 886 aa  62.4  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 573 aa  62  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.31 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  34.86 
 
 		 918 aa  60.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.37 
 
 		 883 aa  60.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 729 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.53 
 
 		 924 aa  60.1  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1768  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 492 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 567 aa  58.9  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 594 aa  58.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  29.44 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 573 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 591 aa  57.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  34.44 
 
 		 579 aa  57  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  27.1 
 
 		 574 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1566  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 738 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.411848  hitchhiker  0.00925631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 		 599 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  21.13 
 
 		 917 aa  55.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  32.46 
 
 		 940 aa  55.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  28.78 
 
 		 584 aa  55.5  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 886 aa  55.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  24.58 
 
 		 632 aa  55.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.71 
 
 		 573 aa  54.7  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 		 582 aa  54.7  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 585 aa  54.7  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  20.16 
 
 		 594 aa  54.3  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.81 
 
 		 784 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 612 aa  54.3  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  23.56 
 
 		 575 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 592 aa  53.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 581 aa  53.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.17 
 
 		 804 aa  53.5  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  29.24 
 
 		 924 aa  53.5  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 873 aa  53.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 575 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 		 931 aa  52.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 568 aa  52.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2959  tetratricopeptide TPR_4  35.29 
 
 		 939 aa  52.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  40.98 
 
 		 573 aa  52  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.95 
 
 		 612 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 613 aa  52  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 613 aa  52  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 511 aa  51.6  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  22.12 
 
 		 590 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.88 
 
 		 818 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 586 aa  50.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 927 aa  50.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 		 563 aa  50.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.93 
 
 		 564 aa  50.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 573 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 559 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 556 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 572 aa  50.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 607 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 		 574 aa  50.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 572 aa  50.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 572 aa  50.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  22.07 
 
 		 559 aa  50.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 607 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  28.76 
 
 		 636 aa  50.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 607 aa  49.3  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.12 
 
 		 594 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2120  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 505 aa  49.7  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  32.2 
 
 		 572 aa  49.3  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  23.15 
 
 		 1073 aa  49.7  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 572 aa  49.3  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.8 
 
 		 553 aa  49.7  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  20.8 
 
 		 603 aa  49.3  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  27.1 
 
 		 584 aa  49.3  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 607 aa  49.3  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>