More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0694 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 577 aa  1164    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  45.91 
 
 		 591 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.55 
 
 		 579 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  41.24 
 
 		 586 aa  423  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.55 
 
 		 571 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.15 
 
 		 582 aa  317  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 		 612 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1768  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.3 
 
 		 602 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 562 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.17 
 
 		 573 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.03 
 
 		 804 aa  87.8  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 594 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  39.52 
 
 		 900 aa  85.9  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 722 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.69 
 
 		 1979 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 		 557 aa  84.3  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  20.04 
 
 		 567 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.21 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.66 
 
 		 2240 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.27 
 
 		 563 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  22.75 
 
 		 929 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0021  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.12 
 
 		 573 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 568 aa  78.2  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 		 931 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  32.14 
 
 		 584 aa  74.7  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.04 
 
 		 935 aa  74.3  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 		 632 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  25.24 
 
 		 625 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.04 
 
 		 1056 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  34.58 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  37.21 
 
 		 587 aa  71.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 		 574 aa  71.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 638 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 613 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  38.39 
 
 		 579 aa  69.3  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.85 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 884 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.92 
 
 		 548 aa  68.6  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 581 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 		 3145 aa  67.8  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  29.44 
 
 		 918 aa  67.4  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.81 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.92 
 
 		 574 aa  67  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 883 aa  67  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1065  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 449 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22 
 
 		 729 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 		 265 aa  66.6  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  22.07 
 
 		 613 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 934 aa  65.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.38 
 
 		 818 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 613 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.84 
 
 		 784 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  35.14 
 
 		 677 aa  64.7  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1121 aa  64.3  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 620 aa  64.3  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  23.86 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 4079 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.89 
 
 		 729 aa  63.9  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 607 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.08 
 
 		 882 aa  63.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 586 aa  63.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.28 
 
 		 639 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 572 aa  63.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  31.53 
 
 		 425 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 265 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 595 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 		 572 aa  63.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 		 786 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 		 566 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 566 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 2262 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 880 aa  62.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 573 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.91 
 
 		 562 aa  62  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 619 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 599 aa  62  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 767 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  22.87 
 
 		 635 aa  62  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  29.08 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 576 aa  61.2  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.71 
 
 		 837 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  22.79 
 
 		 606 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.83 
 
 		 988 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  34.55 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>