220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0021 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0021  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 593 aa  1199    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.55 
 
 		 602 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 562 aa  365  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.72 
 
 		 612 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  24.32 
 
 		 579 aa  131  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.06 
 
 		 571 aa  117  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.58 
 
 		 582 aa  90.9  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.42 
 
 		 579 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.26 
 
 		 577 aa  79.7  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.12 
 
 		 804 aa  77  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 722 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 591 aa  73.9  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 927 aa  73.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  20.4 
 
 		 586 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.48 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  33.62 
 
 		 572 aa  70.9  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  22.58 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  20.83 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.69 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 566 aa  67.4  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 402 aa  67  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 642 aa  65.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 594 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.94 
 
 		 1979 aa  64.7  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  21.09 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 810 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  26.12 
 
 		 591 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.78 
 
 		 599 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 566 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 366 aa  62  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  30.65 
 
 		 621 aa  60.8  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.2 
 
 		 1737 aa  60.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  30.65 
 
 		 621 aa  60.8  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  26.42 
 
 		 607 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 607 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 607 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 607 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  20.74 
 
 		 1276 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  20.75 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 		 4079 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  29.51 
 
 		 584 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  27.27 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 562 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  21.09 
 
 		 602 aa  58.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.84 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 729 aa  57.8  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  19.15 
 
 		 1069 aa  57.4  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 		 594 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.86 
 
 		 581 aa  57.4  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 613 aa  57  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.89 
 
 		 610 aa  57  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 616 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  20.74 
 
 		 568 aa  57  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  27.27 
 
 		 584 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 638 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  19.54 
 
 		 576 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3840  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 350 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.745152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 581 aa  55.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.78 
 
 		 818 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  31.03 
 
 		 635 aa  55.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 610 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 607 aa  54.7  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 613 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  21.24 
 
 		 643 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 572 aa  54.7  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  28.7 
 
 		 632 aa  54.7  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  25.42 
 
 		 583 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 2240 aa  54.3  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 571 aa  54.3  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 		 606 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 606 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  29.52 
 
 		 606 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 606 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 		 606 aa  53.9  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 		 606 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 		 606 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 		 606 aa  54.3  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  20.43 
 
 		 398 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.73 
 
 		 707 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.09 
 
 		 571 aa  53.9  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.7 
 
 		 564 aa  53.5  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 632 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 599 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.46 
 
 		 1056 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 917 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  25.53 
 
 		 677 aa  53.5  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  24.58 
 
 		 592 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 388 aa  52.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>