More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3772 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 562 aa  1154    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.06 
 
 		 602 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0021  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 593 aa  365  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.8 
 
 		 612 aa  256  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  27.73 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 		 582 aa  140  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.02 
 
 		 571 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 		 579 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.56 
 
 		 577 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 591 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.34 
 
 		 810 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03540  hypothetical protein  23.72 
 
 		 432 aa  94.4  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 878 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 2262 aa  92  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 		 804 aa  90.9  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  23.9 
 
 		 586 aa  87  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 		 586 aa  87  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1276 aa  87  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1065  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 767 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.62 
 
 		 883 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.22 
 
 		 548 aa  84.7  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  24.16 
 
 		 682 aa  84  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 3172 aa  84  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.74 
 
 		 1067 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 722 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.36 
 
 		 599 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 4079 aa  80.5  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.06 
 
 		 632 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.4 
 
 		 1737 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.31 
 
 		 1694 aa  77  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.4 
 
 		 887 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.88 
 
 		 573 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  20.96 
 
 		 934 aa  75.1  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.48 
 
 		 1979 aa  73.9  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.53 
 
 		 729 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 573 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.96 
 
 		 557 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 562 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  20.68 
 
 		 2262 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  29.45 
 
 		 572 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.23 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.23 
 
 		 2240 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.84 
 
 		 3301 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 3145 aa  70.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 		 729 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 613 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 		 927 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  22.74 
 
 		 929 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.48 
 
 		 553 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  21.48 
 
 		 603 aa  70.1  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.36 
 
 		 563 aa  70.1  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  19.88 
 
 		 676 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.61 
 
 		 566 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  21.91 
 
 		 573 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  21.44 
 
 		 594 aa  68.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  20.63 
 
 		 567 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  20.82 
 
 		 1069 aa  67.8  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 642 aa  67.8  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 595 aa  67.8  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 594 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.77 
 
 		 818 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  23.06 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 581 aa  67  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.39 
 
 		 576 aa  67  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 566 aa  67  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.54 
 
 		 988 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 486 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1676 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  22.53 
 
 		 606 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 607 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  22.8 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  19.51 
 
 		 1297 aa  65.1  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  18.93 
 
 		 1056 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0158  tetratricopeptide repeat protein  23.27 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.185124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  22.8 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  22.8 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.22 
 
 		 725 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  22.8 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 607 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  22.8 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  22.64 
 
 		 607 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.3 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 		 883 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.3 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  31.67 
 
 		 584 aa  63.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 607 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.93 
 
 		 639 aa  63.5  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 613 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 931 aa  63.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3840  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 350 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.745152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.74 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  18.96 
 
 		 1056 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  21.31 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  19.23 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>