More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2606 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 643 aa  1315    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 1276 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 927 aa  201  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.54 
 
 		 1694 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 878 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 562 aa  164  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 543 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 4079 aa  160  5e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.58 
 
 		 1056 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.54 
 
 		 810 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.72 
 
 		 1022 aa  157  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.22 
 
 		 1056 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.72 
 
 		 1737 aa  153  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.43 
 
 		 1979 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1676 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.23 
 
 		 988 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.2 
 
 		 818 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  23.26 
 
 		 564 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.1 
 
 		 1067 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.58 
 
 		 784 aa  132  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.16 
 
 		 784 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 1297 aa  130  6e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  21.44 
 
 		 1049 aa  126  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.08 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.77 
 
 		 730 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1094 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 634 aa  125  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  22.82 
 
 		 576 aa  124  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.98 
 
 		 887 aa  124  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.54 
 
 		 2240 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 409 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 465 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 602 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1138 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 711 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 		 1069 aa  118  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 409 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 847 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 3172 aa  117  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.41 
 
 		 632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 505 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 375 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  23.77 
 
 		 635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 3035 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  22.8 
 
 		 1013 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 565 aa  112  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.15 
 
 		 486 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 1421 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 366 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.2 
 
 		 707 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 		 2262 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.76 
 
 		 586 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 605 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 828 aa  108  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 566 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 		 409 aa  107  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  21.75 
 
 		 471 aa  107  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.92 
 
 		 462 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 		 4489 aa  107  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  26.93 
 
 		 648 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  20.89 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 828 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.32 
 
 		 436 aa  106  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 750 aa  105  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 761 aa  104  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.75 
 
 		 1154 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.53 
 
 		 614 aa  104  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.53 
 
 		 614 aa  104  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 614 aa  104  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.54 
 
 		 573 aa  104  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.53 
 
 		 626 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.53 
 
 		 626 aa  104  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 614 aa  103  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 		 617 aa  103  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 591 aa  103  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.43 
 
 		 373 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.52 
 
 		 623 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.46 
 
 		 689 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 955 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  21.63 
 
 		 764 aa  101  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 329 aa  101  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 		 3145 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.28 
 
 		 733 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 909 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 935 aa  100  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.46 
 
 		 626 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 589 aa  100  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 612 aa  100  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 615 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 1192 aa  99  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 597 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  21.61 
 
 		 725 aa  99.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  21.5 
 
 		 804 aa  98.6  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.22 
 
 		 292 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  19.94 
 
 		 1056 aa  98.6  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 		 467 aa  98.6  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.87 
 
 		 466 aa  98.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  25 
 
 		 706 aa  98.2  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>