More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2406 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
436 aa  909    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.69 
 
 
1694 aa  207  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
927 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
1276 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
543 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30.42 
 
 
573 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
4079 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
602 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.48 
 
 
810 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 
878 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
562 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.32 
 
 
707 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.25 
 
 
818 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.29 
 
 
1979 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 
1022 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.24 
 
 
1056 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.75 
 
 
725 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.88 
 
 
397 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.9 
 
 
784 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.89 
 
 
564 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 
366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 
565 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.99 
 
 
1138 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.71 
 
 
632 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
1049 aa  141  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.62 
 
 
1056 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
988 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 
1069 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
634 aa  137  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
344 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.4 
 
 
784 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.29 
 
 
462 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.94 
 
 
620 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.06 
 
 
635 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
620 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
955 aa  127  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24 
 
 
730 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  25.37 
 
 
1013 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  27.21 
 
 
1056 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
4489 aa  125  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.6 
 
 
576 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
617 aa  122  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 
711 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.74 
 
 
1067 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.87 
 
 
706 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.62 
 
 
745 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
615 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
467 aa  120  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.27 
 
 
292 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
3035 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.57 
 
 
1737 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.04 
 
 
676 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
402 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
1094 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.4 
 
 
764 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
750 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.77 
 
 
1007 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.2 
 
 
623 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
448 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  23.61 
 
 
626 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23 
 
 
1676 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 
3172 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
409 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
614 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.09 
 
 
626 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 
1297 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
740 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.14 
 
 
689 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.3 
 
 
936 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.01 
 
 
758 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  24.73 
 
 
614 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  24.73 
 
 
614 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
1827 aa  110  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
594 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
614 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  24.73 
 
 
626 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
804 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
512 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  22.15 
 
 
566 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.53 
 
 
733 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
444 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 
567 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
393 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
591 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 
605 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
3145 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
425 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  22.32 
 
 
643 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 
393 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.13 
 
 
887 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>