More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0602 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
586 aa  1191    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
878 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.83 
 
 
810 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  30.57 
 
 
3301 aa  157  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
1276 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 
1737 aa  151  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
3172 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.12 
 
 
1694 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
3035 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
1486 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.69 
 
 
887 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
4079 aa  136  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.32 
 
 
725 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
909 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
927 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 
486 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
716 aa  130  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.95 
 
 
632 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
448 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 
685 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
750 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 
562 aa  125  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  27.3 
 
 
681 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
687 aa  123  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.08 
 
 
730 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
714 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
711 aa  121  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
649 aa  121  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
366 aa  120  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.62 
 
 
818 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.93 
 
 
1676 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
465 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.62 
 
 
784 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
602 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
448 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 
620 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.94 
 
 
832 aa  116  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.1 
 
 
758 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  24.18 
 
 
620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
4489 aa  115  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 
689 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.63 
 
 
1979 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 
3145 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.84 
 
 
676 aa  114  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
718 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
1094 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.06 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28.38 
 
 
661 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.39 
 
 
707 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
634 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24.76 
 
 
643 aa  110  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
761 aa  110  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.15 
 
 
564 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
3560 aa  110  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.66 
 
 
1056 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.35 
 
 
816 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.24 
 
 
1056 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.11 
 
 
267 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
646 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.7 
 
 
1022 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
377 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.87 
 
 
2240 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  27.92 
 
 
979 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 
681 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  22.82 
 
 
714 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.9 
 
 
988 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
523 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
1406 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
1069 aa  107  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
847 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
649 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.07 
 
 
462 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
649 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 
808 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.67 
 
 
764 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
747 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  21.36 
 
 
566 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  23.69 
 
 
833 aa  104  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  22.46 
 
 
573 aa  104  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.43 
 
 
746 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
615 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.4 
 
 
784 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
883 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.5 
 
 
561 aa  103  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
265 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
617 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
762 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  29.32 
 
 
750 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.5 
 
 
561 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 
1061 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 
1049 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.6 
 
 
626 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  21.08 
 
 
792 aa  101  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  28.27 
 
 
743 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
699 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
452 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
597 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
423 aa  100  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 
265 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>