More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3199 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
565 aa  1169    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
927 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
4079 aa  159  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
1069 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 
1276 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 
543 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
1694 aa  143  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.44 
 
 
810 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.58 
 
 
1676 aa  140  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.26 
 
 
436 aa  137  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
878 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 
562 aa  133  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.7 
 
 
576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.98 
 
 
988 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.72 
 
 
1979 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.27 
 
 
725 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.69 
 
 
564 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.29 
 
 
1056 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.74 
 
 
784 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.94 
 
 
818 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.46 
 
 
1138 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
750 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 
2240 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.8 
 
 
462 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.45 
 
 
1067 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  22.92 
 
 
643 aa  120  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.58 
 
 
1056 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.6 
 
 
1022 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
465 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 
1049 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 
602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 
361 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
634 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
617 aa  113  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 
589 aa  113  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  25.98 
 
 
1013 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.08 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
450 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
649 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 
784 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.18 
 
 
730 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26.25 
 
 
936 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.99 
 
 
632 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.89 
 
 
626 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 
1421 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  23.98 
 
 
635 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  30.04 
 
 
745 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.06 
 
 
471 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
652 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.76 
 
 
707 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
376 aa  104  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
515 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.17 
 
 
733 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.27 
 
 
706 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
409 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
3172 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
804 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.27 
 
 
746 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
356 aa  101  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
605 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
652 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
329 aa  101  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4976  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
652 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128988  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3391  tetratricopeptide TPR_2  27.11 
 
 
652 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
620 aa  100  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 
4489 aa  100  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 
1112 aa  100  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.52 
 
 
887 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 
2262 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  25.82 
 
 
442 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.9 
 
 
297 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.9 
 
 
297 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.3 
 
 
706 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
392 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
409 aa  97.4  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
280 aa  97.4  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 
621 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.08 
 
 
314 aa  97.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 
1161 aa  97.1  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  23.97 
 
 
1056 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 
615 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
520 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
711 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
543 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
448 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 
428 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.19 
 
 
1737 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
448 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 
567 aa  94  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.69 
 
 
373 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 
296 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
761 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.97 
 
 
1007 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 
740 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 
468 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  23.45 
 
 
561 aa  92  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 
375 aa  92.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.45 
 
 
561 aa  92.8  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.46 
 
 
466 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>