More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2400 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
520 aa  1066    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  73.45 
 
 
518 aa  763    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  79.69 
 
 
522 aa  847    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  79.88 
 
 
522 aa  845    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 
878 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.93 
 
 
810 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
1737 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.65 
 
 
1694 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
909 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.68 
 
 
632 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
847 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.06 
 
 
1676 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.56 
 
 
1022 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.43 
 
 
639 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.54 
 
 
725 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 
567 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 
448 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 
673 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 
1486 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22 
 
 
573 aa  107  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.86 
 
 
1979 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.47 
 
 
818 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.1 
 
 
733 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 
4079 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.69 
 
 
573 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 
685 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
681 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.24 
 
 
887 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
1276 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
634 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
597 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  24.74 
 
 
638 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 
1421 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.46 
 
 
795 aa  101  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 
927 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
3145 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.15 
 
 
816 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  21.82 
 
 
573 aa  97.8  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  23.08 
 
 
764 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23 
 
 
936 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
565 aa  96.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
362 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.28 
 
 
1056 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
566 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.73 
 
 
2240 aa  95.1  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
649 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.79 
 
 
784 aa  94  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
808 aa  94  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.51 
 
 
1056 aa  94  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 
1069 aa  94  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 
486 aa  94  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.98 
 
 
689 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.18 
 
 
988 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 
645 aa  93.2  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 
465 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.2 
 
 
3172 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
643 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
615 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  25.38 
 
 
955 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 
934 aa  91.3  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26 
 
 
594 aa  90.9  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 
568 aa  90.1  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.15 
 
 
758 aa  90.1  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
762 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 
792 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.11 
 
 
3301 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
562 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 
543 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 
647 aa  87.4  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 
423 aa  87  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 
827 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  24.8 
 
 
1013 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 
632 aa  84  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
2262 aa  84  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  20.92 
 
 
730 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  21.07 
 
 
676 aa  83.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  20.04 
 
 
1154 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.09 
 
 
572 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.64 
 
 
566 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 
637 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.93 
 
 
620 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  25.47 
 
 
714 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.58 
 
 
622 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
718 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.2 
 
 
586 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.97 
 
 
837 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  31.33 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  21.36 
 
 
462 aa  80.9  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.68 
 
 
632 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  31.33 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
955 aa  80.5  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.36 
 
 
436 aa  80.1  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  21.18 
 
 
732 aa  80.1  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 
714 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
219 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.65 
 
 
363 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>