More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5311 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 652 aa  1300    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  91.26 
 
 		 652 aa  1162    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4976  TPR repeat-containing protein  98.47 
 
 		 652 aa  1276    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128988  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3391  tetratricopeptide TPR_2  98.47 
 
 		 652 aa  1276    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 878 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.45 
 
 		 810 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.24 
 
 		 576 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.47 
 
 		 1694 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 927 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 565 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 		 632 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1276 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 4079 aa  100  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 827 aa  96.3  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.3 
 
 		 1056 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 562 aa  95.1  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 543 aa  94.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.5 
 
 		 784 aa  94  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 366 aa  92  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1049 aa  92  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1676 aa  91.3  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.69 
 
 		 988 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.12 
 
 		 1979 aa  90.1  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.93 
 
 		 689 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.38 
 
 		 730 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.57 
 
 		 573 aa  88.6  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.74 
 
 		 818 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 465 aa  87.8  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.52 
 
 		 572 aa  87.4  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 602 aa  87.4  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.48 
 
 		 397 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.52 
 
 		 572 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  22.63 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 634 aa  84.3  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.09 
 
 		 1737 aa  84.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  21 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.35 
 
 		 573 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.97 
 
 		 1022 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 1297 aa  82  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1069 aa  82.4  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 3145 aa  82  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 594 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  79.7  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.19 
 
 		 676 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  21.75 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  20.79 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  21.43 
 
 		 725 aa  79  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.14 
 
 		 2240 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  22.8 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 		 836 aa  77.8  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 909 aa  77.8  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 884 aa  77  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  20.95 
 
 		 3301 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 792 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  23.28 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.03 
 
 		 626 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 202 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 1192 aa  74.7  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.09 
 
 		 1067 aa  74.3  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  21.68 
 
 		 733 aa  73.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.68 
 
 		 292 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  17.54 
 
 		 833 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.13 
 
 		 626 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 589 aa  73.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 568 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 395 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.9 
 
 		 784 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 245 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.21 
 
 		 623 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4312  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.42 
 
 		 554 aa  72.4  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.68 
 
 		 267 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 523 aa  72.4  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 522 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.8 
 
 		 887 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3396  trypsin-like serine protease  26.69 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 573 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.12 
 
 		 1007 aa  71.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 824 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  28.32 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 2262 aa  70.5  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.32 
 
 		 586 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  19.77 
 
 		 409 aa  70.1  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 244 aa  69.3  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 955 aa  69.3  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  21.59 
 
 		 471 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.76 
 
 		 620 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 329 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 		 597 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  20.19 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25.26 
 
 		 587 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  23.99 
 
 		 725 aa  68.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  25.26 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 4489 aa  68.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 635 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>