More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0089 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
388 aa  794    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 
543 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 
602 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.35 
 
 
1694 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
1276 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30 
 
 
573 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
927 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
562 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.39 
 
 
784 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.33 
 
 
1138 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.22 
 
 
576 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
711 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.76 
 
 
1056 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.68 
 
 
988 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.76 
 
 
1056 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.71 
 
 
1979 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
955 aa  109  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.85 
 
 
784 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.37 
 
 
635 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 
329 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1094 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
344 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.27 
 
 
818 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
4489 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.63 
 
 
810 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.53 
 
 
1022 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 
1067 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
279 aa  103  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.86 
 
 
436 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.29 
 
 
833 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
878 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
617 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
4079 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  28.66 
 
 
1013 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.19 
 
 
730 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.08 
 
 
707 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.3 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25 
 
 
292 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
605 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
465 aa  96.3  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.15 
 
 
462 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 
740 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
217 aa  95.9  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 
409 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
409 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
375 aa  94  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  24.77 
 
 
706 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 
3035 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.79 
 
 
745 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  27.08 
 
 
715 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.77 
 
 
564 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 
1276 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
409 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 
591 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.74 
 
 
629 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 
467 aa  89  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
732 aa  88.6  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  24.9 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
750 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  31.82 
 
 
560 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
1049 aa  87.8  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.36 
 
 
632 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
3560 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.46 
 
 
314 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
1069 aa  86.7  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
594 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 
1192 aa  84.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
761 aa  84  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  23.85 
 
 
626 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 
662 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 
2240 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 
542 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
450 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  23.81 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
649 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  31.55 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
512 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  25.88 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.7 
 
 
1007 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.76 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  22.67 
 
 
620 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  22.15 
 
 
706 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  29.51 
 
 
582 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.75 
 
 
1737 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  22.54 
 
 
519 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.82 
 
 
743 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
699 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 
620 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
523 aa  77.4  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 
621 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>