163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1065 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1065  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
449 aa  902    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03540  hypothetical protein  35.22 
 
 
432 aa  256  7e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 
562 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.52 
 
 
602 aa  76.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.1 
 
 
577 aa  66.6  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
409 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  23.57 
 
 
579 aa  65.1  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.32 
 
 
668 aa  65.1  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.89 
 
 
2240 aa  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
329 aa  60.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 
364 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
409 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
409 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  22.06 
 
 
695 aa  57  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.76 
 
 
818 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  21.94 
 
 
267 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.29 
 
 
629 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.73 
 
 
676 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.93 
 
 
1056 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
4079 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 
833 aa  54.3  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  23.2 
 
 
561 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3840  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
350 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.745152 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.2 
 
 
561 aa  53.5  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  24.12 
 
 
1271 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.32 
 
 
730 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.05 
 
 
612 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.67 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.67 
 
 
297 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.95 
 
 
582 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.85 
 
 
1022 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
255 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
1049 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
288 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
565 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 
927 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
3035 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  28.36 
 
 
564 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.36 
 
 
988 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.41 
 
 
571 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
271 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 
542 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
123 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
123 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
562 aa  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 
248 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  21.1 
 
 
265 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.86 
 
 
784 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2077  tetratricopeptide TPR_2  26.87 
 
 
314 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
576 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
3560 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
605 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
392 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  26.94 
 
 
820 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 
884 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 
357 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.28 
 
 
363 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.67 
 
 
707 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 
313 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
1276 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.64 
 
 
265 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.28 
 
 
363 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
573 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 
280 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
245 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 
591 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 
344 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  20.2 
 
 
594 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
344 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  23.97 
 
 
652 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.67 
 
 
557 aa  47.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
1297 aa  47  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  25 
 
 
699 aa  47  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 
287 aa  47  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
634 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 
296 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.27 
 
 
739 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
465 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 
357 aa  47  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  21.01 
 
 
789 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.76 
 
 
449 aa  47  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0296562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
329 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 
233 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.62 
 
 
292 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 
635 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 
208 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.91 
 
 
1694 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.41 
 
 
746 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.76 
 
 
293 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  26.87 
 
 
889 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
375 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 
743 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.24 
 
 
1056 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  19.89 
 
 
1979 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  36.11 
 
 
1764 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.76 
 
 
293 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1542  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 
358 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000957604  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
265 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>