More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0082 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
208 aa  424  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  60.49 
 
 
209 aa  262  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  62.8 
 
 
208 aa  249  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.22 
 
 
212 aa  240  9e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3772  TPR repeat-containing protein  36.18 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0116  TPR repeat-containing protein  35.18 
 
 
207 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.67 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
208 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.99 
 
 
207 aa  121  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0886  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.73 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 
878 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.78 
 
 
810 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
226 aa  99.4  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
3145 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.47 
 
 
988 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
279 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.02 
 
 
784 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
288 aa  85.1  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
718 aa  85.1  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.47 
 
 
818 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  33.15 
 
 
462 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  31.11 
 
 
865 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.12 
 
 
764 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
649 aa  82  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.99 
 
 
1022 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.6 
 
 
632 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
1276 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.44 
 
 
887 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  31.69 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
824 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
762 aa  79  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
280 aa  78.2  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.05 
 
 
820 aa  78.2  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 
1034 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.11 
 
 
622 aa  78.2  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.51 
 
 
725 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.65 
 
 
1056 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  34.83 
 
 
706 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.78 
 
 
573 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 
258 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
697 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
715 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
583 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.88 
 
 
733 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
3035 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.53 
 
 
875 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
833 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 
758 aa  75.5  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
828 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
685 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
1192 aa  75.1  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
828 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.41 
 
 
1056 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
833 aa  74.7  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.75 
 
 
594 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
827 aa  74.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  24.02 
 
 
832 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
1827 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  34.64 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.42 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  32.05 
 
 
750 aa  72.8  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
927 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
573 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
681 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
732 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.82 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.25 
 
 
1694 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
1005 aa  72  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
3560 aa  71.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.03 
 
 
1764 aa  71.6  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  28.57 
 
 
681 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
739 aa  71.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.08 
 
 
816 aa  71.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  33.33 
 
 
581 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
909 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
1406 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
589 aa  70.1  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
626 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.42 
 
 
2240 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 
598 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.5 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.4 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  23.03 
 
 
661 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.32 
 
 
689 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.29 
 
 
1676 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
1421 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 
3172 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
619 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 
617 aa  69.7  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
1737 aa  69.7  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.35 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.91 
 
 
397 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  33.11 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>