45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03540 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03540  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  869    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1065  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 449 aa  256  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 562 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1676 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.95 
 
 		 602 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  23.55 
 
 		 594 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  22.06 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  25.74 
 
 		 929 aa  57.8  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26.68 
 
 		 936 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.76 
 
 		 586 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.42 
 
 		 267 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.66 
 
 		 818 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  21.12 
 
 		 573 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.07 
 
 		 784 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.99 
 
 		 668 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 792 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.83 
 
 		 2240 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.77 
 
 		 265 aa  50.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 		 750 aa  50.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.86 
 
 		 572 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 573 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3840  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 350 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.745152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 		 265 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  22.25 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.74 
 
 		 837 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.55 
 
 		 988 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.64 
 
 		 572 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 800 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 		 2262 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.27 
 
 		 887 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 566 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 534 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0021  TPR repeat-containing protein  20.39 
 
 		 593 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  20.91 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 1406 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 883 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 		 4079 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 934 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1404 aa  43.9  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 1178 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 767 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 		 615 aa  43.1  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>