More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1770 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
393 aa  788    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  84.99 
 
 
393 aa  684    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  85.08 
 
 
395 aa  660    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  48.45 
 
 
402 aa  368  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 
543 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 
1276 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.7 
 
 
1694 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
927 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
562 aa  149  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
602 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.61 
 
 
576 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
955 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
465 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  28.27 
 
 
573 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
711 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
4079 aa  135  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
878 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.14 
 
 
784 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.54 
 
 
1979 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.63 
 
 
730 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.27 
 
 
635 aa  126  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.14 
 
 
1138 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.62 
 
 
564 aa  123  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  28.29 
 
 
1007 aa  122  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
344 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 
632 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.71 
 
 
707 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 
3035 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.84 
 
 
810 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.93 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.47 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.32 
 
 
1013 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
3560 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 
740 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
1737 aa  113  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 
1069 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.01 
 
 
745 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.91 
 
 
2240 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
4489 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.48 
 
 
436 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
617 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
1049 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.1 
 
 
1056 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 
935 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
279 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
414 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
512 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 
591 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
466 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 
747 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.86 
 
 
466 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
1094 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.43 
 
 
1056 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.16 
 
 
1022 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
523 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.53 
 
 
758 aa  100  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.88 
 
 
560 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
1297 aa  99.8  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 
3172 aa  99.8  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
1421 aa  99.8  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  22.25 
 
 
605 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
435 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  23.89 
 
 
465 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 
589 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 
467 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
761 aa  97.8  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.92 
 
 
1676 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.27 
 
 
818 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  21.86 
 
 
626 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.69 
 
 
1056 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  21.13 
 
 
626 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  21.13 
 
 
626 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
687 aa  94.4  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  21.13 
 
 
614 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  21.13 
 
 
614 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  21.13 
 
 
614 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  21.13 
 
 
614 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.04 
 
 
733 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 
828 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 
471 aa  93.6  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
245 aa  93.6  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
468 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  28.16 
 
 
417 aa  92.8  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  26.29 
 
 
623 aa  92.8  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  20.33 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.07 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
634 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  21.15 
 
 
614 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
1192 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.69 
 
 
296 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.95 
 
 
1067 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 
252 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 
597 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 
1827 aa  90.5  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  25.38 
 
 
391 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
409 aa  90.1  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>