More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1919 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 449 aa  920    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0296562  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06745  TPR repeat protein  45.64 
 
 		 463 aa  404  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2590  TPR repeat-containing protein  43.55 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 467 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 466 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.63 
 
 		 476 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.57 
 
 		 466 aa  126  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 465 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.37 
 
 		 465 aa  93.2  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.79 
 
 		 927 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.25 
 
 		 465 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  22.53 
 
 		 620 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 620 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  19.95 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 4079 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 615 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  22.26 
 
 		 626 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 614 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  23.29 
 
 		 614 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  23.29 
 
 		 614 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  23.29 
 
 		 626 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  23.29 
 
 		 626 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 1297 aa  70.9  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.49 
 
 		 2240 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  21.37 
 
 		 594 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  22.47 
 
 		 635 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 612 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.34 
 
 		 745 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 804 aa  67  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  22.05 
 
 		 833 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1138 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.39 
 
 		 1694 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 2262 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 639 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  24.71 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.94 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 		 636 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  24.68 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  24.68 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  21.05 
 
 		 564 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  24.3 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  20.08 
 
 		 1049 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  21.5 
 
 		 1276 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 593 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 279 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 611 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.28 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 562 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  21.25 
 
 		 637 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  20 
 
 		 730 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 467 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.3 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 635 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 635 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.17 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  21.79 
 
 		 725 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.43 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.47 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 750 aa  60.5  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  19.89 
 
 		 3172 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  22.91 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  24.18 
 
 		 992 aa  59.7  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.11 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  22 
 
 		 565 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.72 
 
 		 1056 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.4 
 
 		 784 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 		 860 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  24.03 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  22.96 
 
 		 581 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 3145 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  20.84 
 
 		 681 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 1069 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>