More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1130 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
271 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.38 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  49.81 
 
 
260 aa  250  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.56 
 
 
746 aa  165  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  46.92 
 
 
334 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  43 
 
 
462 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  46.03 
 
 
582 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  44 
 
 
706 aa  148  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.44 
 
 
406 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.44 
 
 
406 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.37 
 
 
738 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  45.73 
 
 
306 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  43.4 
 
 
706 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  40.95 
 
 
539 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.98 
 
 
542 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  39.5 
 
 
376 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  42.44 
 
 
581 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  39.62 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 
373 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.33 
 
 
357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 
547 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
361 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
649 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  36.44 
 
 
820 aa  128  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  37.98 
 
 
392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 
280 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
1421 aa  126  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 
1276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 
617 aa  125  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
249 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 
249 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.68 
 
 
308 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  37.56 
 
 
331 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  39.81 
 
 
371 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 
211 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.24 
 
 
237 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  36.68 
 
 
605 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.49 
 
 
1022 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  38.97 
 
 
404 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  36.67 
 
 
750 aa  118  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 
391 aa  118  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  36.15 
 
 
1240 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 
428 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.86 
 
 
784 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.19 
 
 
1056 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 
458 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0815  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.43 
 
 
310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 
425 aa  115  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.44 
 
 
818 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  40.5 
 
 
352 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.59 
 
 
988 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  34.65 
 
 
1007 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 
446 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
279 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 
292 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 
349 aa  112  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.76 
 
 
471 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0844  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  42.44 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 
515 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  32.83 
 
 
309 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.17 
 
 
839 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 
305 aa  108  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 
292 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
927 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
3035 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
243 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
731 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
458 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  39.15 
 
 
543 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.48 
 
 
1056 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  34.29 
 
 
269 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.17 
 
 
778 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
3560 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
1827 aa  105  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.76 
 
 
289 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.56 
 
 
810 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 
289 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
732 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
1276 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
1192 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  32.32 
 
 
369 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 
878 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  35.29 
 
 
295 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  34.16 
 
 
442 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
290 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
687 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.84 
 
 
632 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
286 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.91 
 
 
286 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.64 
 
 
1694 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
422 aa  99.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  34.76 
 
 
295 aa  99.4  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
593 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>