More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3772 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  72.03 
 
 		 289 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  73.44 
 
 		 289 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  70.38 
 
 		 295 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  66.4 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  66.41 
 
 		 295 aa  353  2e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  65.62 
 
 		 295 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  62.26 
 
 		 291 aa  346  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  42.97 
 
 		 292 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  42.58 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.53 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  39.15 
 
 		 286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.15 
 
 		 286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.91 
 
 		 988 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  36.8 
 
 		 649 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.84 
 
 		 1022 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.2 
 
 		 1056 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.48 
 
 		 1056 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.04 
 
 		 818 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  35.48 
 
 		 462 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  34.8 
 
 		 750 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.59 
 
 		 784 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 878 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 392 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  31.37 
 
 		 706 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 		 361 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  33.48 
 
 		 706 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.48 
 
 		 810 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  34.42 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  35.98 
 
 		 581 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  35.48 
 
 		 539 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 605 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 		 349 aa  122  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 1276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  36.92 
 
 		 820 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.27 
 
 		 746 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1421 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.75 
 
 		 357 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.02 
 
 		 839 aa  118  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.9 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  36.1 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.7 
 
 		 632 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 927 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  33.64 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 450 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 3145 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.77 
 
 		 738 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 1827 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 		 3560 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 543 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 594 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.6 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 342 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 617 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 371 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.17 
 
 		 582 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.85 
 
 		 1007 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.97 
 
 		 629 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.67 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.03 
 
 		 343 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  32.82 
 
 		 442 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  29.86 
 
 		 635 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.43 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.67 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 404 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 376 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 458 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.43 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 		 593 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.97 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 280 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 547 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 515 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  35.52 
 
 		 246 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.24 
 
 		 542 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.19 
 
 		 397 aa  102  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.42 
 
 		 1694 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 3035 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 543 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 465 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.5 
 
 		 778 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 308 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  31.61 
 
 		 385 aa  99.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  32.96 
 
 		 338 aa  99  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 306 aa  99  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  28.4 
 
 		 252 aa  98.6  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  32.97 
 
 		 369 aa  98.6  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 422 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 314 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>