More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1773 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
318 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.04 
 
 
818 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  36.98 
 
 
462 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.21 
 
 
1022 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.78 
 
 
1056 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.45 
 
 
784 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.23 
 
 
1056 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.97 
 
 
988 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  36.4 
 
 
750 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
301 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
392 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  33.91 
 
 
334 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  37.55 
 
 
290 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 
605 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  35.22 
 
 
706 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 
292 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
649 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 
428 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 
446 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.07 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.64 
 
 
839 aa  132  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  37.07 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.07 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  31.89 
 
 
295 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
295 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  33.58 
 
 
706 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  31.89 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 
292 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.94 
 
 
810 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
1421 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  32.19 
 
 
581 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  32.44 
 
 
361 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.35 
 
 
738 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.55 
 
 
878 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
289 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  31.27 
 
 
582 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  36.65 
 
 
820 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  29.08 
 
 
269 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.82 
 
 
632 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.2 
 
 
746 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.17 
 
 
373 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
306 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.6 
 
 
778 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 
406 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 
406 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  33.76 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 
593 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  32.46 
 
 
539 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.34 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
615 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
617 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
279 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
260 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
927 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
547 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.51 
 
 
725 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.24 
 
 
629 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 
261 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
4079 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
342 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  26.06 
 
 
442 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
450 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.34 
 
 
357 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 
542 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 
471 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.84 
 
 
1694 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.41 
 
 
887 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
391 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
306 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
1276 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.19 
 
 
1979 aa  99  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
3145 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.74 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
3035 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 
515 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
1737 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.74 
 
 
249 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.56 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
3172 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
689 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1192 aa  96.7  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  22.83 
 
 
875 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
634 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  27.65 
 
 
745 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
1827 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 
352 aa  93.6  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
827 aa  93.6  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.24 
 
 
764 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.82 
 
 
1007 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.74 
 
 
622 aa  92.4  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
556 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>