More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0454 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
357 aa  719    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  43.09 
 
 
706 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  39.74 
 
 
462 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 
361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  36.47 
 
 
605 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  40.46 
 
 
706 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  41.42 
 
 
334 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 
649 aa  203  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  39.56 
 
 
581 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 
1276 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.03 
 
 
373 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  38.49 
 
 
582 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.69 
 
 
818 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.26 
 
 
1022 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  33.44 
 
 
442 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.43 
 
 
542 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
371 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.91 
 
 
746 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
391 aa  186  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.42 
 
 
406 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.42 
 
 
406 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.88 
 
 
988 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.05 
 
 
784 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  38.28 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  38.32 
 
 
750 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
617 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.43 
 
 
738 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.19 
 
 
1056 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
428 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.59 
 
 
308 aa  177  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 
927 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 
547 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.15 
 
 
1056 aa  176  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
331 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
1421 aa  172  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
422 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
356 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  35.66 
 
 
392 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.46 
 
 
343 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  35.74 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.43 
 
 
471 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  39.26 
 
 
280 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  40.52 
 
 
306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
515 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  41.59 
 
 
539 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
404 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 
543 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 
3035 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 
305 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
4079 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 
1192 aa  153  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.54 
 
 
1694 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
425 aa  150  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
687 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
750 aa  149  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 
878 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
562 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  39.01 
 
 
820 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  38.73 
 
 
211 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 
306 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
804 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
4489 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.78 
 
 
632 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
1827 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 
352 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 
280 aa  144  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.03 
 
 
707 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  33.48 
 
 
1007 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  34.63 
 
 
349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 
261 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
260 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
284 aa  139  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 
376 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
1276 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 
301 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1130  TPR repeat-containing protein  37.33 
 
 
271 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.93 
 
 
784 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
279 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
425 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  40.53 
 
 
243 aa  135  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  45 
 
 
233 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  31.62 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.67 
 
 
810 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.76 
 
 
629 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.62 
 
 
778 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  34.58 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  28.83 
 
 
564 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
602 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  34.58 
 
 
295 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
3560 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
594 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.71 
 
 
397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 
1094 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0815  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 
310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.64 
 
 
730 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  35.15 
 
 
1240 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>