More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0478 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 343 aa  687    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  38.72 
 
 		 462 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  37.5 
 
 		 706 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  37.5 
 
 		 706 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.65 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.98 
 
 		 471 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.15 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.15 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  34.01 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.46 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 1421 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 		 428 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.37 
 
 		 542 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  28.94 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  36.84 
 
 		 581 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 371 aa  157  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  32.48 
 
 		 582 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 617 aa  152  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 605 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  36.84 
 
 		 539 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.05 
 
 		 1022 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  35.57 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 		 649 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.37 
 
 		 778 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 547 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.31 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.49 
 
 		 746 aa  142  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.11 
 
 		 988 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 515 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 1276 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.86 
 
 		 1056 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.8 
 
 		 818 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.58 
 
 		 1056 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 280 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 		 356 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 3035 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.71 
 
 		 784 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  33.89 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 465 aa  123  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 284 aa  123  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.96 
 
 		 1694 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.41 
 
 		 839 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.06 
 
 		 738 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 4489 aa  122  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 3560 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 927 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.02 
 
 		 397 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 301 aa  116  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  31.2 
 
 		 750 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 1192 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 		 878 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 750 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 804 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1827 aa  113  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  33.48 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.75 
 
 		 632 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  30.58 
 
 		 820 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.9 
 
 		 810 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.66 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  37.5 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 1094 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  33.03 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.88 
 
 		 249 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.88 
 
 		 249 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 602 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 556 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 4079 aa  105  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 594 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.2 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  33.03 
 
 		 269 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.75 
 
 		 1979 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.62 
 
 		 286 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 1240 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.09 
 
 		 1007 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.19 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 543 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>