More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2382 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 778 aa  1533    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.29 
 
 		 784 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.42 
 
 		 818 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.87 
 
 		 1022 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.42 
 
 		 1056 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.1 
 
 		 988 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.59 
 
 		 1056 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  49.67 
 
 		 839 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.84 
 
 		 629 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  51.24 
 
 		 718 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  51.79 
 
 		 713 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  55.9 
 
 		 619 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  54.71 
 
 		 495 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  53.25 
 
 		 708 aa  244  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  52.84 
 
 		 479 aa  244  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  39.72 
 
 		 462 aa  236  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 392 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 		 649 aa  200  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  37.05 
 
 		 706 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  37.13 
 
 		 706 aa  194  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  44.98 
 
 		 486 aa  191  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 1421 aa  187  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  35.86 
 
 		 361 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  42.36 
 
 		 477 aa  181  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  41.81 
 
 		 576 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 617 aa  173  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 306 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.13 
 
 		 490 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.46 
 
 		 860 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.05 
 
 		 859 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 		 605 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  37.01 
 
 		 334 aa  167  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 371 aa  167  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40 
 
 		 1155 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.34 
 
 		 810 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 		 878 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  39.83 
 
 		 449 aa  164  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  40.24 
 
 		 582 aa  164  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.92 
 
 		 728 aa  163  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.3 
 
 		 502 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.69 
 
 		 746 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 556 aa  160  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.39 
 
 		 445 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.49 
 
 		 373 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.49 
 
 		 680 aa  158  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  35.71 
 
 		 581 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.92 
 
 		 554 aa  156  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  39.66 
 
 		 499 aa  154  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.34 
 
 		 738 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.98 
 
 		 971 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  37.98 
 
 		 971 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.96 
 
 		 472 aa  152  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.33 
 
 		 489 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.45 
 
 		 485 aa  150  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.96 
 
 		 481 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.65 
 
 		 421 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.13 
 
 		 485 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.37 
 
 		 343 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.09 
 
 		 308 aa  145  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.42 
 
 		 632 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 428 aa  144  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 		 349 aa  144  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 		 331 aa  144  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  33.09 
 
 		 306 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.38 
 
 		 542 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.07 
 
 		 406 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.07 
 
 		 406 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 284 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.84 
 
 		 478 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 446 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.63 
 
 		 486 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  35.98 
 
 		 750 aa  138  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.84 
 
 		 515 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  41.71 
 
 		 280 aa  137  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  33.09 
 
 		 539 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 404 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  30.97 
 
 		 442 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  34.7 
 
 		 308 aa  135  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 927 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.96 
 
 		 471 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  37.83 
 
 		 547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 515 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 1276 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.18 
 
 		 357 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  32.91 
 
 		 276 aa  127  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 422 aa  127  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 1192 aa  127  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 450 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.44 
 
 		 766 aa  126  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 		 458 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  36.7 
 
 		 820 aa  124  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 425 aa  123  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  36.29 
 
 		 342 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  35.22 
 
 		 527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 280 aa  120  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.09 
 
 		 649 aa  120  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 687 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 391 aa  119  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.23 
 
 		 1694 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>