More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2418 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  60.84 
 
 		 792 aa  908    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 827 aa  1693    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  56.72 
 
 		 762 aa  897    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 657 aa  275  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 708 aa  248  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 812 aa  242  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 657 aa  237  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 766 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 605 aa  232  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 570 aa  221  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 878 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.92 
 
 		 810 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 638 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 879 aa  195  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 616 aa  194  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  31.92 
 
 		 575 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  31.53 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.51 
 
 		 653 aa  178  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 		 602 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.86 
 
 		 654 aa  174  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.54 
 
 		 632 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  27.34 
 
 		 540 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  30.36 
 
 		 566 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 639 aa  156  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 3145 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.87 
 
 		 988 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 909 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 795 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 715 aa  147  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  29.42 
 
 		 648 aa  147  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  29.8 
 
 		 634 aa  147  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.43 
 
 		 1022 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.61 
 
 		 1056 aa  146  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.56 
 
 		 818 aa  145  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 3172 aa  144  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.17 
 
 		 784 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.75 
 
 		 699 aa  142  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 643 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 681 aa  139  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 685 aa  138  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 847 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.16 
 
 		 1694 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.15 
 
 		 733 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.61 
 
 		 1056 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 744 aa  135  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 790 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  32.47 
 
 		 816 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 645 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.22 
 
 		 795 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 927 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1676 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 808 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 686 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 1737 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 3035 aa  129  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.3 
 
 		 576 aa  129  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 		 641 aa  127  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 686 aa  126  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  33.98 
 
 		 865 aa  126  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 362 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.27 
 
 		 725 aa  125  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3897  hypothetical protein  27.18 
 
 		 648 aa  125  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 3301 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 697 aa  124  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 648 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.93 
 
 		 689 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 1421 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  23.69 
 
 		 681 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.99 
 
 		 462 aa  122  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 824 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 718 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 637 aa  121  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.62 
 
 		 764 aa  121  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 597 aa  121  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 649 aa  121  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  28.93 
 
 		 580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 4079 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.54 
 
 		 2240 aa  118  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 593 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1371 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 543 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 828 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 1276 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.08 
 
 		 887 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 486 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 		 1486 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 750 aa  114  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 935 aa  114  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.95 
 
 		 745 aa  114  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 612 aa  114  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 750 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.35 
 
 		 732 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 505 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 828 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 284 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.54 
 
 		 676 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 392 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  30.56 
 
 		 714 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 613 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 828 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>