More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5110 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 
878 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.13 
 
 
810 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.6 
 
 
2240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  27.07 
 
 
833 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 
1056 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.82 
 
 
1022 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  32.9 
 
 
649 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
632 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.86 
 
 
818 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.17 
 
 
1056 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.71 
 
 
784 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
927 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.78 
 
 
626 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.78 
 
 
626 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
614 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.78 
 
 
614 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.78 
 
 
614 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.68 
 
 
988 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
614 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
614 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.36 
 
 
626 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
3145 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.37 
 
 
758 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.45 
 
 
875 aa  102  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.74 
 
 
340 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.06 
 
 
820 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
1252 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.13 
 
 
576 aa  99.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
409 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
1252 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
1276 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
1371 aa  99.4  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
280 aa  99  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
685 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.8 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
612 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
718 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
615 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
750 aa  96.3  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
448 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
4489 aa  95.9  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
639 aa  95.5  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  25.21 
 
 
594 aa  95.5  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
635 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
366 aa  94  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
635 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
636 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 
611 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
637 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
828 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  30.17 
 
 
1101 aa  92.8  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
465 aa  92.4  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 
409 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
620 aa  92  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.1 
 
 
603 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.33 
 
 
397 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
1094 aa  92  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.22 
 
 
587 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.02 
 
 
689 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  29.27 
 
 
887 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
2262 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.81 
 
 
620 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  28.29 
 
 
681 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 
212 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 
828 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
361 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.53 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 
847 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.21 
 
 
816 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
219 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
3035 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.73 
 
 
865 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.2 
 
 
622 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
909 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  28.64 
 
 
219 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  28.5 
 
 
545 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 
409 aa  90.1  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  28.64 
 
 
219 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.87 
 
 
764 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  28.64 
 
 
219 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  28.64 
 
 
219 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.5 
 
 
1676 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  28.64 
 
 
219 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 
219 aa  89.4  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  28.64 
 
 
219 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.55 
 
 
733 aa  89.4  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  28.64 
 
 
219 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 
594 aa  89  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  28.7 
 
 
566 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  26.6 
 
 
992 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  25.89 
 
 
577 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.59 
 
 
208 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 
209 aa  87  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
4079 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.7 
 
 
265 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
375 aa  86.7  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>