More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0666 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  82.55 
 
 
880 aa  1437    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  100 
 
 
889 aa  1796    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41.58 
 
 
863 aa  572  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38 
 
 
916 aa  529  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  41.57 
 
 
585 aa  258  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2753  Serine/threonine protein kinase-related protein  44.7 
 
 
517 aa  247  6e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.11 
 
 
627 aa  245  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  42.76 
 
 
612 aa  243  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
703 aa  243  9e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.91 
 
 
650 aa  242  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  43.87 
 
 
625 aa  241  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  44.52 
 
 
618 aa  240  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.8 
 
 
632 aa  238  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  41.54 
 
 
691 aa  238  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  41.54 
 
 
692 aa  237  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  44.03 
 
 
661 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  43.56 
 
 
621 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  44.52 
 
 
617 aa  236  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  42.8 
 
 
638 aa  235  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  43.6 
 
 
520 aa  234  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  47.79 
 
 
571 aa  234  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.23 
 
 
627 aa  233  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  48.16 
 
 
599 aa  231  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.44 
 
 
715 aa  231  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.13 
 
 
662 aa  230  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  47.15 
 
 
666 aa  228  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  41.16 
 
 
511 aa  227  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.06 
 
 
602 aa  227  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.66 
 
 
645 aa  226  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  41.88 
 
 
349 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 
776 aa  226  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.94 
 
 
613 aa  226  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3625  protein kinase  42.65 
 
 
665 aa  225  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160356  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.39 
 
 
579 aa  224  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  46.04 
 
 
1053 aa  224  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  46.18 
 
 
618 aa  224  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  41.19 
 
 
646 aa  223  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  39.62 
 
 
612 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.27 
 
 
520 aa  223  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.07 
 
 
668 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  45.6 
 
 
1057 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  38.44 
 
 
624 aa  221  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  38.44 
 
 
624 aa  221  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  38.44 
 
 
624 aa  221  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.42 
 
 
653 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  38.24 
 
 
625 aa  220  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  42.16 
 
 
618 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.68 
 
 
598 aa  219  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.29 
 
 
681 aa  218  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  42.07 
 
 
938 aa  218  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  41.4 
 
 
750 aa  218  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  42.44 
 
 
615 aa  217  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.98 
 
 
652 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  45.39 
 
 
569 aa  215  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  44.11 
 
 
673 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  42.44 
 
 
700 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.89 
 
 
850 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.7 
 
 
822 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  37 
 
 
625 aa  213  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40 
 
 
798 aa  212  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3845  protein kinase  47.27 
 
 
531 aa  212  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111657  hitchhiker  0.000135014 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.42 
 
 
1023 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  45.85 
 
 
468 aa  212  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  40 
 
 
626 aa  212  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.96 
 
 
603 aa  211  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  37.9 
 
 
455 aa  211  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.68 
 
 
658 aa  210  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.03 
 
 
518 aa  210  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.66 
 
 
641 aa  210  1e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40 
 
 
667 aa  209  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  38.79 
 
 
651 aa  210  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  41.7 
 
 
597 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  39.33 
 
 
593 aa  210  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  38.33 
 
 
439 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.93 
 
 
676 aa  209  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  40.88 
 
 
661 aa  209  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.33 
 
 
584 aa  208  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  38.85 
 
 
691 aa  208  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
746 aa  208  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  41.64 
 
 
598 aa  207  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.29 
 
 
700 aa  207  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  39.3 
 
 
666 aa  207  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40 
 
 
681 aa  207  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  39.27 
 
 
891 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.18 
 
 
769 aa  206  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 
625 aa  206  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.4 
 
 
528 aa  205  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 
565 aa  205  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  40.22 
 
 
609 aa  204  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.26 
 
 
613 aa  204  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.28 
 
 
668 aa  204  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  39.62 
 
 
668 aa  204  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  40.65 
 
 
552 aa  204  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  43.82 
 
 
586 aa  204  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  44.11 
 
 
368 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  38.73 
 
 
919 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.11 
 
 
664 aa  203  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  44.03 
 
 
583 aa  203  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  38.87 
 
 
635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  40.52 
 
 
869 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>