More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0531 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 287 aa  566  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  47.52 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  47.52 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  44.64 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  46.34 
 
 		 297 aa  244  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.12 
 
 		 291 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  47.45 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  41.52 
 
 		 288 aa  205  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  41.07 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  36.02 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  35.02 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.668643  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  34.87 
 
 		 287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0006  hypothetical protein  38.46 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  35.56 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  37.76 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.62 
 
 		 1694 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  31.44 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 878 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.96 
 
 		 725 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.04 
 
 		 810 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 718 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 3145 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.73 
 
 		 875 aa  82  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.65 
 
 		 622 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  31.61 
 
 		 733 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 		 632 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.65 
 
 		 764 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2046  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.29 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.278718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.14 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 927 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 750 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 1406 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 543 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2087  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000840047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 3301 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.56 
 
 		 626 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.13 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 1737 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.41 
 
 		 587 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 3172 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 3035 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 935 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  27.04 
 
 		 1154 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.16 
 
 		 887 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  26.92 
 
 		 661 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.26 
 
 		 1056 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 503 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 409 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.89 
 
 		 2240 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.4 
 
 		 833 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.57 
 
 		 988 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.14 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1676 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  25 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 1979 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 		 1252 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1827 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.19 
 
 		 681 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  25.75 
 
 		 676 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.65 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.65 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.65 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.65 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 465 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 614 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 762 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  24.49 
 
 		 635 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 909 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  27.32 
 
 		 452 aa  66.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 649 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 4079 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 934 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 573 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.7 
 
 		 689 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 620 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.73 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>