More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1139 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  97.76 
 
 		 357 aa  705    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 357 aa  718    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  45.33 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  46.5 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1542  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 		 358 aa  259  6e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000957604  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 878 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 750 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.36 
 
 		 810 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 4079 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1676 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 827 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 1038 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 927 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 		 649 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.11 
 
 		 1022 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 792 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.4 
 
 		 837 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.77 
 
 		 582 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  28.65 
 
 		 887 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 762 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.67 
 
 		 560 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.72 
 
 		 745 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 1069 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 3145 aa  73.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.96 
 
 		 632 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  27.47 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 567 aa  72.8  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.1 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 		 265 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.12 
 
 		 725 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.22 
 
 		 1154 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26 
 
 		 875 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.29 
 
 		 758 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 543 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.63 
 
 		 1694 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.36 
 
 		 676 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.25 
 
 		 668 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  25.58 
 
 		 623 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25.87 
 
 		 715 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 750 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1138 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.23 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.7 
 
 		 1034 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.68 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.66 
 
 		 2240 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 313 aa  67  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  24.58 
 
 		 1764 aa  67  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 217 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 605 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.73 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.48 
 
 		 576 aa  66.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 620 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.14 
 
 		 462 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.47 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 		 615 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 2262 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.28 
 
 		 988 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 870 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 612 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.81 
 
 		 818 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 565 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  24.22 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.12 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.25 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.12 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  24.61 
 
 		 706 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.75 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.08 
 
 		 1979 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.8 
 
 		 573 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.09 
 
 		 865 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.33 
 
 		 733 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.28 
 
 		 1056 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.04 
 
 		 917 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.23 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.38 
 
 		 1056 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1276 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  21.31 
 
 		 750 aa  63.9  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>