More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1384 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
870 aa  1749    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
3145 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
718 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  35.6 
 
 
743 aa  87  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
827 aa  84.7  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 
543 aa  84.3  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 
762 aa  84.3  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
686 aa  81.6  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 
632 aa  81.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  27.27 
 
 
413 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
878 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
615 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.24 
 
 
626 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 
614 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 
614 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.24 
 
 
626 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.24 
 
 
614 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 
614 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.24 
 
 
614 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.15 
 
 
620 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.36 
 
 
810 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  23.26 
 
 
781 aa  78.6  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.12 
 
 
725 aa  77.8  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.96 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
3035 aa  77  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
4489 aa  77  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.85 
 
 
733 aa  77.4  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.6 
 
 
875 aa  77.4  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
1827 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
620 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  31.79 
 
 
816 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3396  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 
1075 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 
612 aa  76.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
716 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
503 aa  76.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
248 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.11 
 
 
1676 aa  75.5  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
909 aa  75.1  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.37 
 
 
560 aa  74.3  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
1276 aa  74.3  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
767 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
583 aa  73.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  26.5 
 
 
561 aa  73.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.73 
 
 
603 aa  73.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.14 
 
 
626 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 
505 aa  73.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0054  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
227 aa  73.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
602 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.38 
 
 
738 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
750 aa  72.8  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
639 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
714 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.42 
 
 
289 aa  72  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  29.73 
 
 
837 aa  71.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
645 aa  71.6  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 
293 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  26.07 
 
 
561 aa  71.6  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.23 
 
 
714 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
637 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
2262 aa  71.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
635 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
635 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 
557 aa  70.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
637 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
611 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.52 
 
 
758 aa  70.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  27.88 
 
 
269 aa  70.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
739 aa  70.1  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 
607 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
879 aa  70.1  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.57 
 
 
587 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
441 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 
833 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
441 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
612 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25 
 
 
1764 aa  68.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1421 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
636 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.47 
 
 
784 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  27.2 
 
 
670 aa  68.6  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.11 
 
 
988 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
1252 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
685 aa  68.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
1094 aa  68.2  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
3560 aa  68.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
587 aa  68.2  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28.89 
 
 
661 aa  67.8  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
818 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.86 
 
 
1056 aa  67  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
357 aa  67.4  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 
289 aa  67.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
377 aa  67  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.69 
 
 
865 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
288 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 
792 aa  67  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 
2240 aa  66.6  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>