More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1483 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
221 aa  454  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  40.82 
 
 
1694 aa  135  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 
878 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 
543 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
927 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.84 
 
 
810 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.16 
 
 
397 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
1276 aa  114  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  40.12 
 
 
4489 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  34.76 
 
 
573 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 
465 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 
3035 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.2 
 
 
836 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  32.99 
 
 
417 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
4079 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  35.32 
 
 
745 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  37.65 
 
 
560 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 
681 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 
3560 aa  105  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1094 aa  105  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 
279 aa  105  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  32.12 
 
 
620 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
562 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
620 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 
626 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.34 
 
 
706 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  35.23 
 
 
1979 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
366 aa  102  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
718 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  31.63 
 
 
1138 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
1049 aa  102  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 
602 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.66 
 
 
632 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 
685 aa  101  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  33.5 
 
 
398 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
602 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
3145 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.57 
 
 
764 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
732 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  35.95 
 
 
202 aa  99.8  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  29.27 
 
 
622 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
955 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
612 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
740 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  30.89 
 
 
519 aa  98.6  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.32 
 
 
1022 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
909 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
1737 aa  98.2  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.43 
 
 
314 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
637 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.15 
 
 
623 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  36.64 
 
 
816 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
615 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.79 
 
 
707 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  32.21 
 
 
1007 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 
523 aa  95.5  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 
636 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 
662 aa  95.9  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
617 aa  94.4  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.17 
 
 
730 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.32 
 
 
466 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  37.82 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
639 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
601 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 
1056 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
739 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
715 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
465 aa  92.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 
1005 aa  92  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  30.61 
 
 
715 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
700 aa  91.7  7e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 
1034 aa  91.7  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
635 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
635 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
356 aa  91.7  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  29.73 
 
 
539 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
573 aa  91.7  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 
1276 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  35.88 
 
 
340 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 
395 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
611 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  33.81 
 
 
608 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
1827 aa  90.5  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.22 
 
 
587 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
754 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 
466 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
1069 aa  90.5  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.07 
 
 
725 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.04 
 
 
561 aa  90.5  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
1486 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.04 
 
 
561 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  36.3 
 
 
795 aa  89.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
637 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
754 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
362 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  29.53 
 
 
937 aa  89  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
512 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
762 aa  89  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  39.02 
 
 
191 aa  88.6  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>