19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3371 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  100 
 
 		 413 aa  830    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 870 aa  63.5  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4478  O-antigen polymerase  27.06 
 
 		 608 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.26 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  24.58 
 
 		 436 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  22.59 
 
 		 737 aa  54.3  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  22.47 
 
 		 471 aa  53.9  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  25.41 
 
 		 612 aa  51.2  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3495  hypothetical protein  26.95 
 
 		 617 aa  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000341769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  23.77 
 
 		 781 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  26.1 
 
 		 1070 aa  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  23.22 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  19.87 
 
 		 874 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  23.72 
 
 		 470 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4235  O-antigen polymerase  32.53 
 
 		 474 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000407687  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  23.94 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  27.61 
 
 		 502 aa  43.5  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  24.37 
 
 		 457 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  24.37 
 
 		 457 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>