39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1088 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  100 
 
 		 737 aa  1499    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  25 
 
 		 461 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  25.36 
 
 		 467 aa  90.9  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 457 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  26.2 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.57 
 
 		 457 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  24.4 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  25.18 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  28.35 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.38 
 
 		 540 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  26.3 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  25.53 
 
 		 754 aa  60.1  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  22.29 
 
 		 612 aa  58.9  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  22.78 
 
 		 781 aa  57.8  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  22.59 
 
 		 413 aa  54.3  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  30.53 
 
 		 930 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  24.43 
 
 		 874 aa  52.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 717 aa  52  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25 
 
 		 501 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  21.18 
 
 		 492 aa  50.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  23.86 
 
 		 438 aa  49.3  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2494  O-antigen polymerase  27.11 
 
 		 563 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  24.79 
 
 		 594 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  25.63 
 
 		 561 aa  47.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  21.43 
 
 		 784 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  31.58 
 
 		 402 aa  47.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  26.85 
 
 		 495 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  21.04 
 
 		 870 aa  47.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  22.14 
 
 		 532 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  24.41 
 
 		 438 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  33.01 
 
 		 433 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  22.92 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  25 
 
 		 735 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  25.82 
 
 		 498 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  23.11 
 
 		 580 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  28.28 
 
 		 509 aa  45.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  25.69 
 
 		 452 aa  45.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2985  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  24.58 
 
 		 474 aa  44.3  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>