50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4957 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  100 
 
 		 470 aa  941    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  65.11 
 
 		 457 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  64.89 
 
 		 457 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  60.04 
 
 		 461 aa  551  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  55.41 
 
 		 471 aa  512  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  57.33 
 
 		 475 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  55.99 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  51.19 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  40.26 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  39.7 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  38 
 
 		 438 aa  216  8e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  28.22 
 
 		 781 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  24.4 
 
 		 737 aa  91.3  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  24.24 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  24.44 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  29.63 
 
 		 540 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  27.11 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  24.32 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  23.59 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  23.12 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  24.09 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  25.72 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  26.8 
 
 		 930 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  22.84 
 
 		 492 aa  57  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24.72 
 
 		 773 aa  56.6  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  23.44 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  28.64 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  28.7 
 
 		 440 aa  54.3  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  27.66 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  24.47 
 
 		 464 aa  51.2  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  23.58 
 
 		 461 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  24.41 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  30.97 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  24.32 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  24.58 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  24.36 
 
 		 754 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  33.33 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  22.22 
 
 		 494 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  27.09 
 
 		 549 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  20.37 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  22.93 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  21.23 
 
 		 612 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3152  O-antigen polymerase  25.18 
 
 		 546 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  28.03 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  26.14 
 
 		 498 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  21.38 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  25.67 
 
 		 502 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>