87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3113 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  100 
 
 
467 aa  935    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  23.53 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  23.88 
 
 
496 aa  80.5  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  25.67 
 
 
471 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  24.11 
 
 
474 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  22.28 
 
 
461 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  24.07 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  25.22 
 
 
402 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  23.84 
 
 
470 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  22.79 
 
 
467 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  26.71 
 
 
428 aa  63.9  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  27.32 
 
 
773 aa  63.9  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  25.25 
 
 
540 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  24.27 
 
 
612 aa  63.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  22.79 
 
 
503 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  35.83 
 
 
504 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  24.13 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  25.71 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  25.71 
 
 
457 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  37.78 
 
 
829 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  22.66 
 
 
512 aa  57.4  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  27.22 
 
 
500 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  23.82 
 
 
784 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  21.81 
 
 
594 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  28.29 
 
 
498 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  34.12 
 
 
1070 aa  54.3  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  26.67 
 
 
495 aa  53.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  22.86 
 
 
595 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  22.86 
 
 
595 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  22.86 
 
 
595 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  22.86 
 
 
595 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  21.35 
 
 
594 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  22.86 
 
 
595 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  23.56 
 
 
467 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  22.46 
 
 
661 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  29.73 
 
 
425 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2808  O-antigen polymerase  22.42 
 
 
494 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  23.19 
 
 
595 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  22.86 
 
 
595 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  23.6 
 
 
475 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  25.81 
 
 
389 aa  50.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  20.75 
 
 
532 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  35.63 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  28.83 
 
 
461 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  22.4 
 
 
874 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  32.4 
 
 
806 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  28.57 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  23.17 
 
 
930 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  23.08 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  25 
 
 
459 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1123  O-antigen polymerase  31.58 
 
 
442 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6488  O-antigen polymerase  31.58 
 
 
442 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  23.45 
 
 
492 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4465  O-antigen polymerase  26.26 
 
 
479 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000989096  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  24.21 
 
 
592 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  24.21 
 
 
592 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  26.72 
 
 
1090 aa  47.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  24.21 
 
 
592 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  23.65 
 
 
428 aa  47  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  31.87 
 
 
412 aa  47  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  24.31 
 
 
480 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  22.13 
 
 
501 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  23.65 
 
 
737 aa  47  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  27.78 
 
 
454 aa  46.6  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  33.33 
 
 
586 aa  46.6  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  25.69 
 
 
426 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  31.76 
 
 
588 aa  46.6  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  26.96 
 
 
466 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  33.33 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  32.94 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  28.19 
 
 
429 aa  45.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  25.56 
 
 
425 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  25.73 
 
 
442 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  22.12 
 
 
593 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  26.45 
 
 
426 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  31.33 
 
 
440 aa  44.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  30.77 
 
 
401 aa  44.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  29.63 
 
 
463 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  22.3 
 
 
535 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  22.33 
 
 
781 aa  43.9  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  29.03 
 
 
436 aa  43.9  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  30.7 
 
 
686 aa  43.5  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  25.91 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  34.21 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  30.7 
 
 
686 aa  43.5  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  31.88 
 
 
434 aa  43.1  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>