53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2455 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  100 
 
 
435 aa  879    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  26.8 
 
 
425 aa  89.7  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  24.4 
 
 
468 aa  89  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  26.09 
 
 
436 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  24.32 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  23.5 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  23.08 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  23.4 
 
 
463 aa  73.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  23.27 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  29.72 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  27.49 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  22.04 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  21.21 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  30.34 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  27.46 
 
 
540 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  23.49 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  23.19 
 
 
452 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  25.76 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  29.64 
 
 
415 aa  63.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  32.47 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  32.43 
 
 
465 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  19.27 
 
 
466 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  30.06 
 
 
459 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  29.59 
 
 
461 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  26.05 
 
 
773 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4498  O-antigen polymerase  26.87 
 
 
447 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  28.65 
 
 
443 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  32.34 
 
 
437 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  26.36 
 
 
474 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  23.46 
 
 
436 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  25.31 
 
 
754 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  24.22 
 
 
454 aa  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  27.5 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  22.33 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  28.92 
 
 
434 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  26.8 
 
 
532 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  28.99 
 
 
512 aa  47.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  30 
 
 
470 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  27.78 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  23.14 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  27.78 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  27.78 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.1 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5250  O-antigen polymerase  28.49 
 
 
336 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  28.57 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  26.72 
 
 
456 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  27.78 
 
 
404 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  26.32 
 
 
467 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  27.7 
 
 
389 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2726  O-antigen polymerase  28.14 
 
 
434 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.43 
 
 
471 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  27.78 
 
 
404 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  27.1 
 
 
413 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>