39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0103 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  100 
 
 		 492 aa  961    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  38.46 
 
 		 461 aa  270  4e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  35.47 
 
 		 458 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  30.95 
 
 		 436 aa  192  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  35.07 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  34.92 
 
 		 431 aa  133  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  26.83 
 
 		 467 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  25.64 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  23.79 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  25.64 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  26.24 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  26.53 
 
 		 471 aa  72  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  22.13 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  25.39 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  22.87 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  23.43 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  21.18 
 
 		 737 aa  60.5  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  22.97 
 
 		 781 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25.69 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0733  O-antigen polymerase  23.99 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  24.63 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  27.76 
 
 		 459 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  23.02 
 
 		 459 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.62 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  24.81 
 
 		 474 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  25.16 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  24.62 
 
 		 560 aa  48.5  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  22.78 
 
 		 504 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  22.62 
 
 		 754 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.49 
 
 		 496 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1928  O-antigen polymerase  24.68 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0538104  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  27.39 
 
 		 500 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0851  O-antigen polymerase  31.09 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  23.45 
 
 		 467 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  27.27 
 
 		 454 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  25.98 
 
 		 428 aa  43.5  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  28.31 
 
 		 443 aa  43.1  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>