84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4864 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  100 
 
 		 467 aa  910    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  59.16 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  58.51 
 
 		 475 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  55.99 
 
 		 470 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  53.52 
 
 		 461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  53.55 
 
 		 467 aa  451  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  51.88 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  51.66 
 
 		 457 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  43.23 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  41.65 
 
 		 436 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  43.7 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  30.61 
 
 		 781 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  28.92 
 
 		 540 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  27.36 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  26.81 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  23.81 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  25.14 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  25.18 
 
 		 737 aa  77.8  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  23.02 
 
 		 461 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.5 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  26.3 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  23.64 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  25.79 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  22.41 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  28.21 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  26.72 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  26.73 
 
 		 754 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  29.91 
 
 		 498 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  26.19 
 
 		 930 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  32.67 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  28.83 
 
 		 500 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  28.41 
 
 		 549 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  22.43 
 
 		 773 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  27.2 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  32.51 
 
 		 468 aa  53.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  30.69 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  27.63 
 
 		 504 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  26.7 
 
 		 494 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  26.22 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  28.5 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  26.09 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  23.64 
 
 		 467 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3537  membrane protein PslJ  27.68 
 
 		 471 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0975897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  28.78 
 
 		 459 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.5 
 
 		 501 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  32.79 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  28.48 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  30.29 
 
 		 436 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  25 
 
 		 497 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  27 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  24 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  27.91 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  28.46 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  26.78 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  24.56 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  28.7 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  27.35 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  25.53 
 
 		 446 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  26.54 
 
 		 443 aa  46.6  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3375  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221665  normal  0.11504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  27.4 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  25.91 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  35.51 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  29.36 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  25.51 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  26.98 
 
 		 661 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  21.88 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  26.36 
 
 		 595 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  26.36 
 
 		 595 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  26.36 
 
 		 595 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  26.36 
 
 		 595 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  26.36 
 
 		 595 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  29.12 
 
 		 590 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  32.47 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  32.26 
 
 		 686 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  27.54 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  32.26 
 
 		 686 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  26.36 
 
 		 595 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  26.7 
 
 		 446 aa  43.5  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  27.76 
 
 		 594 aa  43.5  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 738 aa  43.5  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  25.4 
 
 		 456 aa  43.5  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  26.14 
 
 		 1009 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>