74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2363 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  869    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  27.53 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  30.9 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  26.62 
 
 		 452 aa  113  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  29.35 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  28.53 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  26.46 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  33.47 
 
 		 436 aa  100  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  27.9 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  27.92 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  26.17 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  24.93 
 
 		 468 aa  87  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  25.77 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  27.38 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  25.77 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  28.11 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  28.47 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  23.32 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  26.57 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  28.27 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  25.1 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  26.37 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  24.56 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  26.89 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  29.71 
 
 		 472 aa  67  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  27.86 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  25.74 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  24.1 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  31.87 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  31.93 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  36 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  25.58 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  31.03 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  22.78 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  24.4 
 
 		 453 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  31.32 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2726  O-antigen polymerase  30.34 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  26.2 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  24.92 
 
 		 461 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  26.98 
 
 		 412 aa  53.5  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  24.15 
 
 		 532 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  27.53 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  26.07 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  31.72 
 
 		 672 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  28.37 
 
 		 436 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  35.35 
 
 		 438 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  27.98 
 
 		 717 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  26.49 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  27.06 
 
 		 737 aa  48.9  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  27.54 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  32.08 
 
 		 512 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2266  O-antigen polymerase  23.37 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330742 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  28.76 
 
 		 460 aa  47.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  32.28 
 
 		 438 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  21.71 
 
 		 431 aa  46.6  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 754 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  30.12 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  27.14 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  28.66 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  26.16 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  26.16 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  25.35 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  25.35 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  25.61 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  25.7 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  26.86 
 
 		 668 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  27.21 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  31.05 
 
 		 671 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  32.29 
 
 		 470 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  23.92 
 
 		 414 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  24.22 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  26.89 
 
 		 580 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  28.45 
 
 		 418 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>