81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0508 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  100 
 
 		 440 aa  868    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  25.91 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  32.71 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  32.71 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  32.71 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  32.71 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  32.71 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  31.78 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  25.12 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1153  hypothetical protein  25.9 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  31.03 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  43.02 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1662  hypothetical protein  23.98 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  24.93 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  26.91 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  24.15 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  35.9 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  28.35 
 
 		 773 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  28.7 
 
 		 470 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  37.5 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  29.31 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  35.71 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  37.18 
 
 		 661 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  37.18 
 
 		 595 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  37.18 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  37.18 
 
 		 595 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  37.18 
 
 		 595 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  37.18 
 
 		 595 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  31.39 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  29.06 
 
 		 457 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  37.18 
 
 		 595 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  27.11 
 
 		 461 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  31.62 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.79 
 
 		 540 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  34.59 
 
 		 498 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  29.06 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 593 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  28.81 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  25.94 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  37.36 
 
 		 496 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  36.14 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2741  O-antigen polymerase  29.46 
 
 		 333 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.448774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  32.48 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  27.69 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  30 
 
 		 592 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  30 
 
 		 592 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  32.48 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  30 
 
 		 592 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  25.12 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  30.33 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  29.66 
 
 		 475 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  32.1 
 
 		 594 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  42.86 
 
 		 738 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  41.98 
 
 		 504 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  31.15 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  25.75 
 
 		 498 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  34.71 
 
 		 467 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  24.55 
 
 		 1090 aa  47  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1411  hypothetical protein  25.62 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  27.45 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  31.4 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  29.49 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  27.34 
 
 		 612 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  35.21 
 
 		 537 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1918  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998924 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  29.82 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  28.07 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  22.36 
 
 		 561 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  31.82 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  28.07 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  33.64 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 594 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  30.47 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1241  hypothetical protein  35.79 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  22.56 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  28.07 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  28.07 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  27.19 
 
 		 426 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  23.81 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  24.83 
 
 		 389 aa  43.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>