99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3103 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  79.76 
 
 		 500 aa  771    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  100 
 
 		 498 aa  978    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  27.51 
 
 		 501 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  30.18 
 
 		 668 aa  79.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  28.94 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  26.71 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  27.76 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  27.55 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  25.16 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  22.83 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  30.55 
 
 		 672 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  30.8 
 
 		 671 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  25.44 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  28.97 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  26.34 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  27.18 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  34.33 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  28.77 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  23.36 
 
 		 781 aa  60.1  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  30 
 
 		 500 aa  60.1  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  31.54 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  29.76 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  29.29 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  28.63 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  26.36 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  25.27 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  27.6 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  27.83 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  27.95 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  23.5 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  24.25 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  25.85 
 
 		 612 aa  56.6  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.42 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  26.33 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  24.88 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  24.25 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 532 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  24.81 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  20.82 
 
 		 773 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  29.27 
 
 		 444 aa  53.9  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  24.03 
 
 		 404 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  23.48 
 
 		 404 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  28.63 
 
 		 463 aa  53.5  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.07 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  26.9 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  24.43 
 
 		 456 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  24.4 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  26.07 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  27.44 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2018  O-antigen polymerase  29.63 
 
 		 523 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000808268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2737  O-antigen polymerase  29.45 
 
 		 542 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  24.17 
 
 		 404 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 480 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  23.7 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  23.08 
 
 		 436 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  23.7 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  29.28 
 
 		 504 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05350  O-antigen polymerase, Wzy protein  26.96 
 
 		 467 aa  50.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00185086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  23.7 
 
 		 404 aa  50.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  25 
 
 		 492 aa  50.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  28.37 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  24.53 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  27.2 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2808  O-antigen polymerase  22.45 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  24.9 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0733  O-antigen polymerase  26.82 
 
 		 485 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  28.95 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  26.76 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  24.36 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  27.44 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  25.75 
 
 		 440 aa  47  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  28.49 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  28.52 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  25.76 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  31.58 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  29.14 
 
 		 717 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0480  hypothetical protein  26.55 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  28.16 
 
 		 438 aa  45.4  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  30 
 
 		 832 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1952  O-antigen polymerase  30.77 
 
 		 653 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.953343  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  26.29 
 
 		 537 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  25.85 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  28.73 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  23.51 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 679 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  28.04 
 
 		 438 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  32.12 
 
 		 436 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  28.32 
 
 		 465 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  34.12 
 
 		 465 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  28.48 
 
 		 418 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  28.8 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  24.24 
 
 		 512 aa  43.9  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 393 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>