86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4268 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  100 
 
 		 503 aa  983    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  71.19 
 
 		 504 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  43.92 
 
 		 496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  40.38 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  27.54 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  25.34 
 
 		 754 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  28.93 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  27.79 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.48 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  21.31 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  29.9 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  29.9 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  27.49 
 
 		 671 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  31.58 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  29.01 
 
 		 393 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  28.06 
 
 		 545 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  25.35 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  43.02 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  32.64 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  27.36 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  26.3 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  25 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  26.34 
 
 		 672 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  26.03 
 
 		 494 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  29.01 
 
 		 498 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  28.06 
 
 		 402 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  26.28 
 
 		 686 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  26.28 
 
 		 686 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  26.65 
 
 		 506 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  24.78 
 
 		 561 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  26.81 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  26.79 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  25.2 
 
 		 540 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  27.2 
 
 		 498 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  26.37 
 
 		 475 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  24.12 
 
 		 532 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  27.74 
 
 		 470 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  27.2 
 
 		 594 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  22.69 
 
 		 437 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  25.28 
 
 		 418 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 594 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0733  O-antigen polymerase  24.66 
 
 		 485 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4478  O-antigen polymerase  26.73 
 
 		 608 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  25.09 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  28.24 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  23.04 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  24.51 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  27.85 
 
 		 500 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  27.94 
 
 		 668 aa  47.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  21.43 
 
 		 438 aa  47.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.38 
 
 		 512 aa  47.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  31.65 
 
 		 773 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  21.93 
 
 		 784 aa  47.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  24.39 
 
 		 456 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  26.29 
 
 		 466 aa  47  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  32.23 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  23.94 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  26.71 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  29.28 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  29.21 
 
 		 1009 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  26.98 
 
 		 735 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  23.6 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  23.74 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  26.86 
 
 		 661 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  27.87 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  27.87 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  27.87 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  27.87 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  27.87 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  25.63 
 
 		 589 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  20.93 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  22.75 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2080  O-antigen polymerase  32.43 
 
 		 411 aa  43.9  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.473077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 426 aa  43.9  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  23.33 
 
 		 463 aa  43.9  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  27.87 
 
 		 595 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  26.47 
 
 		 454 aa  43.5  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  37.68 
 
 		 586 aa  43.9  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  28.64 
 
 		 465 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 426 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 426 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05350  O-antigen polymerase, Wzy protein  28.26 
 
 		 467 aa  43.5  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00185086  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 497 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 426 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>