71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0279 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  100 
 
 		 438 aa  847    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  65.97 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  70.28 
 
 		 438 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  39.8 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  44.08 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  43.31 
 
 		 467 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  38.59 
 
 		 470 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  40.73 
 
 		 457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  40.73 
 
 		 457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  37.5 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  37.01 
 
 		 471 aa  243  5e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  28.5 
 
 		 781 aa  159  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  32.27 
 
 		 540 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  28.82 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  29.83 
 
 		 496 aa  73.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  29 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  23.81 
 
 		 737 aa  59.3  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  36.36 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  31.84 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  27.35 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  29.26 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 754 aa  56.6  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  29.8 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  23.11 
 
 		 532 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  25.45 
 
 		 773 aa  53.1  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  28.23 
 
 		 459 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  27.75 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  27.02 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  27.44 
 
 		 404 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  25.94 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  25.75 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  29.06 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  27.44 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  27.44 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  27.44 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  25.94 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  29.63 
 
 		 503 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  33.73 
 
 		 503 aa  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  29.09 
 
 		 435 aa  49.7  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  30.16 
 
 		 498 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  26.85 
 
 		 436 aa  49.7  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  36.9 
 
 		 894 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.1 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  27.36 
 
 		 1025 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1775  hypothetical protein  26.74 
 
 		 713 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  27.07 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  27.1 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  23.01 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  27.18 
 
 		 504 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  27.67 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  30.54 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  32.32 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  31.58 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  28.85 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  27.83 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  20.2 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  27.95 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  35 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3179  O-antigen polymerase  33.98 
 
 		 638 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  39.74 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  29.19 
 
 		 647 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4026  O-antigen polymerase  29.39 
 
 		 499 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  30.99 
 
 		 468 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  29.2 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  23.36 
 
 		 413 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  27.91 
 
 		 620 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  29.85 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  29.11 
 
 		 402 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  28.38 
 
 		 494 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  31.88 
 
 		 506 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>