62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0069 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  97.97 
 
 		 443 aa  831    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  100 
 
 		 443 aa  875    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  66.67 
 
 		 431 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  58.56 
 
 		 443 aa  458  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  33.61 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  34 
 
 		 540 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  28.38 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  23.31 
 
 		 773 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  26.1 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3375  O-antigen polymerase  28.99 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221665  normal  0.11504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  26.23 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  28.33 
 
 		 498 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 594 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  26.77 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  26.77 
 
 		 408 aa  50.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  35.8 
 
 		 358 aa  50.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  30.06 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  29.47 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  29.47 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  25.4 
 
 		 404 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  29.82 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  25.4 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  25.4 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  27.67 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  25.4 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  28.87 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0480  hypothetical protein  28.57 
 
 		 452 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  27.4 
 
 		 594 aa  47  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  28.68 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  23.86 
 
 		 612 aa  46.2  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  28.87 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  23.04 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  23.87 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  22.94 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  23.87 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  26.35 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  28.9 
 
 		 686 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  30.08 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  28.9 
 
 		 686 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  29.49 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.1 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  28.18 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3912  O-antigen ligase  23.15 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0464096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1303  hypothetical protein  28.42 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.424505  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3931  O-antigen ligase  23.15 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  24.62 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 500 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  35.44 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  32.47 
 
 		 509 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  32.18 
 
 		 446 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4038  O-antigen ligase  23.15 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  29.07 
 
 		 545 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2125  O-antigen polymerase  25 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  27.52 
 
 		 434 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  27.13 
 
 		 413 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  28.39 
 
 		 422 aa  43.1  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4099  O-antigen ligase  22.9 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>