21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3526 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  100 
 
 		 668 aa  1303    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  29.48 
 
 		 671 aa  161  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  30.27 
 
 		 672 aa  158  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  28.03 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.57 
 
 		 498 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.27 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  27.16 
 
 		 437 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  30.85 
 
 		 686 aa  60.1  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  30.85 
 
 		 686 aa  60.1  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  32.32 
 
 		 717 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  27.93 
 
 		 496 aa  53.9  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  23.83 
 
 		 512 aa  52.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  23.78 
 
 		 468 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  31.9 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  29.76 
 
 		 438 aa  47.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  27.43 
 
 		 428 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  23.43 
 
 		 781 aa  45.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  28.12 
 
 		 503 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 466 aa  45.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  26.02 
 
 		 418 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  27.01 
 
 		 456 aa  43.9  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>