41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2530 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  100 
 
 
463 aa  921    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  63.09 
 
 
466 aa  588  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  45.47 
 
 
472 aa  332  8e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  41.11 
 
 
468 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  34.74 
 
 
428 aa  256  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  32.9 
 
 
452 aa  226  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  33.41 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  33.57 
 
 
436 aa  211  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  33.1 
 
 
444 aa  202  8e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  32.03 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  30.39 
 
 
454 aa  162  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  26.74 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  25.64 
 
 
453 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  23.44 
 
 
487 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  25.05 
 
 
460 aa  96.7  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  26 
 
 
431 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  27.57 
 
 
464 aa  82.4  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  30.5 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  23.4 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  24.07 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  25.86 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  30.63 
 
 
461 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.32 
 
 
501 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  22.5 
 
 
425 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  25.86 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  24.08 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  23.13 
 
 
446 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  26.58 
 
 
500 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  28.44 
 
 
498 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  27.87 
 
 
471 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  23.53 
 
 
415 aa  47.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  26.39 
 
 
432 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  28.08 
 
 
504 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  29.11 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  33.02 
 
 
434 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  26 
 
 
500 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  32.24 
 
 
540 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  26.72 
 
 
435 aa  44.3  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  26.22 
 
 
418 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  26.35 
 
 
443 aa  43.1  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  25.61 
 
 
418 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>