55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2737 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2737  O-antigen polymerase  100 
 
 
542 aa  1072    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2018  O-antigen polymerase  55.53 
 
 
523 aa  442  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000808268  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  40.58 
 
 
2658 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0137  hypothetical protein  41.07 
 
 
192 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  30.39 
 
 
594 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  31.28 
 
 
393 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  29.7 
 
 
498 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  30.04 
 
 
594 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  31.02 
 
 
540 aa  59.7  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  28.82 
 
 
437 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  37.17 
 
 
661 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  37.17 
 
 
595 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  37.17 
 
 
595 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  27.75 
 
 
612 aa  56.2  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  37.17 
 
 
595 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  37.17 
 
 
595 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  37.17 
 
 
595 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  37.17 
 
 
595 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  28.68 
 
 
500 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  26.98 
 
 
500 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  37.17 
 
 
595 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  31.18 
 
 
754 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  36.79 
 
 
592 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  28.18 
 
 
496 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  36.79 
 
 
592 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  36.79 
 
 
593 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  36.79 
 
 
592 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  36.9 
 
 
894 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  24.7 
 
 
504 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  25.2 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  31.88 
 
 
431 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  30.3 
 
 
607 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  22.41 
 
 
773 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  29.67 
 
 
413 aa  48.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  41.54 
 
 
428 aa  48.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  30.5 
 
 
425 aa  47.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  30.5 
 
 
440 aa  47.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  28.66 
 
 
436 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  27.65 
 
 
443 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  39.56 
 
 
595 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  23.53 
 
 
532 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  34.48 
 
 
443 aa  45.4  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  34.48 
 
 
443 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  29.32 
 
 
435 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  31.45 
 
 
531 aa  45.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1351  O-antigen polymerase  29.41 
 
 
448 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0480  hypothetical protein  27.97 
 
 
452 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  27.87 
 
 
436 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  29.73 
 
 
480 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  26.45 
 
 
501 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  34.51 
 
 
454 aa  43.9  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  27.14 
 
 
461 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  25 
 
 
509 aa  43.9  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  32.32 
 
 
416 aa  43.9  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2346  O-antigen polymerase  32.88 
 
 
481 aa  43.5  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>