32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3401 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 464 aa  907    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  26.07 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  21.52 
 
 		 501 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.84 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  26.51 
 
 		 500 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05350  O-antigen polymerase, Wzy protein  28.7 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00185086  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  29.7 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  20.82 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  23.92 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  23.09 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  23.95 
 
 		 428 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  25.64 
 
 		 456 aa  53.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  22.09 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  25.34 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.42 
 
 		 496 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  35.63 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  28.67 
 
 		 439 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4235  O-antigen polymerase  23.18 
 
 		 474 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000407687  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  25.77 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  24 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  27.69 
 
 		 440 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  29.85 
 
 		 432 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  24.62 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25.81 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  23.49 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  25.29 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  22.18 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  25.9 
 
 		 437 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0465  O-antigen polymerase  25.17 
 
 		 486 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.216322  normal  0.610525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  29.37 
 
 		 414 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  30.48 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  32.53 
 
 		 435 aa  43.9  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>